R-markdown：python日志记录包似乎是问题的根源

我面临着一个奇怪的问题，可以追溯到python

日志记录

包。让我简单地解释一下我想做什么：目标是用python创建html报告。我使用的是R包，它使用本地virtualenv运行python代码

问题： 我一安装python

logging

包，rmarkdown在加载

matplotlib

时就会遇到问题。我已经编写了一个小的测试脚本来重现这个示例

我的系统：

• Ubuntu 18.04仿生版
• Python 2.7.15rc1

测试“1”脚本（无

日志记录
）：


创建一个新的virtualenv（
venv
）
使用
venv/bin/pip
安装
matplotlib
运行
networkite:：import
（最后通过
rmarkdown:：render
）

测试“2”脚本（使用
日志记录
）：


创建一个新的virtualenv（
venv
）
除第一次测试外：通过
venv/bin/pip
安装
日志记录

使用
venv/bin/pip
安装
matplotlib
运行
networkite:：import
（最后通过
rmarkdown:：render
）

已安装的模块（virtualenv）：

模块（matplotlib）
输出是通过
networkite:：import
加载模块的成功消息。可以看到，只有一个测试失败，其中virtualenv与安装的
logging
python模块一起使用

有人知道这些问题的原因吗？我花了相当长的时间来确定错误的来源，但我现在有点迷路了

测试脚本以再现错误：

这里有一个小的bash/shell脚本来重现我的测试

#!/bin/bash
# New virtual environment and install matplotlib
echo " ----------- no logging package installed ------------"
if [ -d venv ] ; then rm -rf venv ; fi
virtualenv venv &>/dev/null > /dev/null
venv/bin/pip install matplotlib > /dev/null

# Print installed packages
Rscript -e "reticulate::use_python('venv/bin/python'); reticulate::import('matplotlib')"
Rscript -e "reticulate::import('matplotlib')"

# New virtual environment and install logging and matplotlib
echo " --------- with logging package installed ------------"
if [ -d venv ] ; then rm -rf venv ; fi
virtualenv venv > /dev/null
venv/bin/pip install logging > /dev/null
venv/bin/pip install matplotlib > /dev/null

# Print installed packages
Rscript -e "reticulate::use_python('venv/bin/python'); reticulate::import('matplotlib')"
Rscript -e "reticulate::import('matplotlib')"

我最初认为这与“问题”有关，但解决方案不起作用

请提前感谢！
R
记录2.3版Python库中包含的标准模块。您不能从PyPI安装它。请尽快将其删除：

pip uninstall logging

#!/bin/bash
# New virtual environment and install matplotlib
echo " ----------- no logging package installed ------------"
if [ -d venv ] ; then rm -rf venv ; fi
virtualenv venv &>/dev/null > /dev/null
venv/bin/pip install matplotlib > /dev/null

# Print installed packages
Rscript -e "reticulate::use_python('venv/bin/python'); reticulate::import('matplotlib')"
Rscript -e "reticulate::import('matplotlib')"

# New virtual environment and install logging and matplotlib
echo " --------- with logging package installed ------------"
if [ -d venv ] ; then rm -rf venv ; fi
virtualenv venv > /dev/null
venv/bin/pip install logging > /dev/null
venv/bin/pip install matplotlib > /dev/null

# Print installed packages
Rscript -e "reticulate::use_python('venv/bin/python'); reticulate::import('matplotlib')"
Rscript -e "reticulate::import('matplotlib')"

pip uninstall logging