Python 仅在输出中使用Snakemake通配符

我有一个脚本，它接收一个大的输入文件，然后使用一个不可预测的算法将其分解为从1到n的多个块

然后，下面的脚本将迭代地处理每个块

我如何创建一个snakemake规则，该规则本质上声明输出文件将从1到n存在，并且以下脚本应该为1到n个输入文件中的每个文件运行一次

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谢谢

您是否尝试过设置通配符？例如，如果对文件1到22迭代规则，可以在snakemake文件的顶部设置通配符：

num=range(1,23)

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然后在snakemake文件名中使用该通配符，或者在{wildcard.num}

中引用它，因为有

动态

。它可以这样使用：

rule all:
    input:
        dynamic('{id}.png')


rule draw:
    input:
        '{id}.txt'
    output:
        '{id}.png'
    shell:
        'cp {input} {output}'


rule cluster:
    input:
        'input.csv'
    output:
        dynamic('{id}.txt')
    shell:
        'touch 1.txt 2.txt'

你考虑过这个选择吗？