Graphviz'；找不到的可执行文件（Python 3.4）

我正在Windows7上运行Python3.4。我正在尝试为graphviz使用Python接口。这是我打算运行的脚本：

from graphviz import Digraph
import pydotplus

dot = Digraph(comment='The Round Table')

dot.node('A', 'King Arthur')
dot.node('B', 'Sir Bedevere the Wise')
dot.node('L', 'Sir Lancelot the Brave')
dot.edges(['AB', 'AL'])
dot.edge('B', 'L', constraint='false')

print(dot.source)
dot.render('test-output/round-table.gv', view=True)

我在运行时遇到以下错误：

RuntimeError: failed to execute ['dot', '-Tpdf', '-O', 'test-output/round-table.gv'], make sure the Graphviz executables are on your systems' path

现在我确信我已经正确安装了正确的依赖项。我首先尝试设置正确的环境变量。graphviz可执行文件位于C:\Program Files（x86）\graphviz 2.37\bin中，因此我转到了环境变量部分。这里有两个部分：用户变量和系统变量。在“系统变量”下，我单击了路径，然后单击编辑，添加了内容；将C:\Program Files（x86）\Graphviz2.37\bin添加到字符串末尾并保存。这并没有清除错误

然后，根据答案，我卸载了pydot（实际上我在这里使用pydotplus）并重新安装，但仍然没有成功

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我已经尝试了几个小时来解决这个问题，而整个路径变量的问题令人困惑和沮丧。

正如它所显示的，Graphviz2.37在windows上的路径变量存在问题。我卸载了它，删除了与之相关的环境变量，而是下载并安装了更新的beta版本2.39，现在它就像一个魔咒一样工作。

在jupyter（ipython）上win10中带有anaconda的笔记本电脑我通过

conda安装graphviz

解决了这个问题。在我通过

pip安装graphviz
安装graphviz之后，我在Ubuntu（14.04）和Jupyter上遇到了同样的问题

为了解决这个问题，我在pythonsys.path中添加了点库

第一：检查是否安装了dot

然后：
找到他的路径
点在哪里
->/local/notebook/miniconda2/envs/ik2/bin/dot

最后在python脚本中：sys.path.append（“/local/notebook/miniconda2/envs/ik2/bin/dot”）
在我的例子中（Win10、Anaconda3、Jupyter notebook），在
之后，“conda安装graphviz”
我必须添加到路径：
C:\Users\username\Anaconda3\Library\bin\graphviz

要修改路径，请转到
控制面板>系统和安全>系统>高级系统设置>环境变量>路径>编辑>新建
我解决了直接从
安装的问题https://graphviz.gitlab.io/_pages/Download/Download_windows.html
并包括在windows路径中：

C:\Program Files (x86)\Graphviz2.38\bin

C:\Program Files (x86)\Graphviz2.38

在我重新启动windows之后，当您将C:\Program Files（x86）\Graphviz 2.38\bin添加到PATH中时，您必须关闭IDE环境（如spyder）并重新启动，您将解决“运行时错误：确保Graphviz可执行文件位于系统路径上”
要解决此问题，请在成功安装Graphviz 2.38后，然后将您的路径变量添加到系统路径。在系统变量下，您可以单击路径，然后单击编辑并添加；将C:\Program Files（x86）\Graphviz2.38\bin添加到字符串末尾并保存。然后，像spyper一样重新启动pythonIDE，它就会正常工作

别忘了关闭Spyder，然后重新启动。
我在Ubuntu 16.04上也遇到了这个问题

除了我已经执行的pip安装之外，通过运行sudo apt get install graphviz
进行修复。
我在Windows 10上也遇到了同样的问题

首先，我使用以下命令安装了
graphviz-2.38.0
，没有任何问题

install -c anaconda graphviz=2.38.0

install -c conda-forge pydotplus

其次，我使用以下命令安装了
pydotplus
，没有任何问题

install -c anaconda graphviz=2.38.0

install -c conda-forge pydotplus

在那之后，当我开始可视化我的决策树时，
{InvocationException:GraphViz的可执行文件找不到}

C:\Users\admin\Anaconda3\lib\site-packages\pydotplus\graphviz.py in create(self, prog, format)
   1958             if self.progs is None:
   1959                 raise InvocationException(
-> 1960                     'GraphViz\'s executables not found')
   1961 
   1962         if prog not in self.progs:

InvocationException: GraphViz's executables not found

在我的例子中，我所要做的就是将
graphviz
可执行文件的环境路径放在我的user
path
环境变量中，这就解决了它。只需确保它是
您的.exe文件所在的路径：）

由于没有提到Mac OS，我要补充的是，我在OS X Yosemite上也遇到了同样的问题，我找到的解决方案是执行
brew安装graphviz

这就解决了问题，我不确定我是否应该编辑这个列表中的其他答案之一，因为它们似乎都是相同的答案，只需在Python库之外安装一个官方软件包。
只需安装即可

conda install graphviz

然后安装

conda install -c conda-forge pydotplus

对于Windows8.1和Python2.7，我通过以下步骤修复了这个问题

一,。下载并安装graphviz-2.38.msi

二,。设置路径变量


控制面板>系统和安全>系统>高级系统设置>环境变量>路径>编辑
添加“C:\ProgramFiles（x86）\Graphviz2.38\bin”
我在Anaconda 3上使用Windows 10和Python 3.6，并且遇到了同样的问题

我通过按顺序执行以下操作使其正常工作：

从Anaconda终端：pip安装pydotplus
从Anaconda终端：conda安装pydotplus
从Anaconda码头：pip安装graphviz
来自Anaconda终端：conda安装graphviz
转到Windows环境变量、路径，并在Anaconda的graphviz目录下添加了my dot.exe文件的位置
之后工作正常。
如果您在Win10上，请安装Graphviz，然后使用以下命令添加路径

import os
os.environ["PATH"] += os.pathsep + 'C:\Program Files (x86)\Graphviz2.38/bin/'

请注意，我使用的是windows 10。以下部分可能适用于或不适用于其他版本的windows或操作系统：



**注2:*

“系统上的Graphviz bin文件地址”可以是C:\Program Files（x86）\Graphviz 2.38\bin或安装Graphviz的任何其他路径。


我们不仅在Graphviz上有问题，而且在Jupyter中要使用的其他外部EXE文件上也有问题。

原因是当jupyter想要导入一个包时，它会在工作目录中查找该包，当它找不到该包时，它会返回此类错误。

我们能做的就是解决这个问题如下：

1） 检查您的系统上是否安装了Graphviz，如果没有，您可以
import os
os.environ["PATH"] += os.pathsep + r'the Graphviz bin file address on your system'

def create(self, prog=None, format='ps'):

if prog not in self.progs:
    raise InvocationException(
        'GraphViz\'s executable "%s" not found' % prog)

if not os.path.exists(self.progs[prog]) or \
        not os.path.isfile(self.progs[prog]):
    raise InvocationException(
        'GraphViz\'s executable "{}" is not'
        ' a file or doesn\'t exist'.format(self.progs[prog])
    )

  self.progs[prog] = "C:/Program Files (x86)/Graphviz2.38/bin/gvedit.exe"`

if prog not in self.progs:
    raise InvocationException(
        'GraphViz\'s executable "%s" not found' % prog)

self.progs[prog] = "C:/Program Files (x86)/Graphviz2.38/bin/gvedit.exe"

if not os.path.exists(self.progs[prog]) or \
        not os.path.isfile(self.progs[prog]):
    raise InvocationException(
        'GraphViz\'s executable "{}" is not'
        ' a file or doesn\'t exist'.format(self.progs[prog])
    )

conda install -c anaconda graphviz
conda install -c conda-forge python-graphviz

import sklearn.datasets as datasets
import pandas as pd
from sklearn.tree import DecisionTreeClassifier
iris=datasets.load_iris()
df=pd.DataFrame(iris.data, columns=iris.feature_names)
y=iris.target

dtree=DecisionTreeClassifier()
dtree.fit(df,y)

from sklearn.externals.six import StringIO  
from IPython.display import Image  
from sklearn.tree import export_graphviz
import pydotplus
import graphviz
import os
os.environ\["PATH"\] += os.pathsep + 'C:/Users/tstusr/AppData/Local/Continuum/anaconda3/pkgs/Graphviz2.38/bin'

dot_data = StringIO()
export_graphviz(dtree, out_file=dot_data,  
                filled=True, rounded=True,
                special_characters=True)
graph = pydotplus.graph_from_dot_data(dot_data.getvalue())  
Image(graph.create_png())

import os

os.environ['PATH'] = os.environ['PATH']+';'+os.environ['CONDA_PREFIX']+r"\Library\bin\graphviz"

import sys

sys.path.append('C:/Users/usrname/AppData/Local/Continuum/anaconda3/Library/bin/graphviz/')

dot.set_graphviz_executables( {'dot': r'C:\Program Files\Graphviz\bin\dot.exe'})

    This method allows to manually specify the location of the GraphViz
    executables.

    The argument to this method should be a dictionary where the keys are
    as follows:

        {'dot': '', 'twopi': '', 'neato': '', 'circo': '', 'fdp': ''}

    and the values are the paths to the corresponding executable,
    including the name of the executable itself.