Python 使用字典时出现KeyError:3
我试图在一个模拟中计算水的氢键数量,我有3000个水分子(1000个氧和2000个氢)。所以我为它写了一个代码 我有一个数据帧(Python 使用字典时出现KeyError:3,python,dataframe,dictionary,if-statement,keyerror,Python,Dataframe,Dictionary,If Statement,Keyerror,我试图在一个模拟中计算水的氢键数量,我有3000个水分子(1000个氧和2000个氢)。所以我为它写了一个代码 我有一个数据帧(df1),在这个数据帧中,我看到氧原子的位置 是3的倍数(0,3,6,…)和其他位置的氢原子和 原子的x,y,z坐标(xi,yi,zi)。现在进行HB计算I 需要两个距离小于3.5的氧原子,即d1AKeyError在您尝试访问dict中不存在的密钥时被触发。如果这发生在If(record[j]==4或record[i]==4)行中,则意味着j或i被设置为3,并且reco
df1
),在这个数据帧中,我看到氧原子的位置
是3的倍数(0,3,6,…)和其他位置的氢原子和
原子的x,y,z坐标(xi,yi,zi)
。现在进行HB计算I
需要两个距离小于3.5的氧原子,即
d1AKeyError
在您尝试访问dict中不存在的密钥时被触发。如果这发生在If(record[j]==4或record[i]==4)
行中,则意味着j
或i
被设置为3,并且record[3]
不存在
如果记录[3]
应该存在,您需要弄清楚为什么不设置它。从您的代码来看,如果某个特定值通过if(d1),则该值似乎只会添加到记录中
import math
count=0
record={}
for i in range(0,3000,3):
for j in range (i+3,3000,3):
flag=0
x1=0
y1=0
z1=0
d1=0
x1=df1['xi'][i]-df1['xi'][j]
y1=df1['yi'][i]-df1['yi'][j]
z1=df1['zi'][i]-df1['zi'][j]
d1=math.sqrt((x1**2)+(y1**2)+(z1**2))
if (d1<3.5):
if(flag==0):
for k in range(1,3,1):
x2=0
y2=0
z2=0
d2=0
x2=df1['xi'][i+k]-df1['xi'][i]
y2=df1['yi'][i+k]-df1['yi'][i]
z2=df1['zi'][i+k]-df1['zi'][i]
d2=math.sqrt((x2**2)+(y2**2)+(z2**2))
x3=0
y3=0
z3=0
d3=0
x3=df1['xi'][i+k]-df1['xi'][j]
y3=df1['yi'][i+k]-df1['yi'][j]
z3=df1['zi'][i+k]-df1['zi'][j]
d3=math.sqrt((x3**2)+(y3**2)+(z3**2))
final=0
final=math.acos(((d2**2)+(d3**2)-(d1**2))/(2*(d2*d3)))
if (final<0.523):
if j not in record:
record.update({j:1})
else :
record[j]=record[j]+1
if i not in record:
record.update({i:1})
else :
record[i]=record[i]+1
count=count+1
flag=1
if (flag==0):
for l in range(1,3,1):
x2=0
y2=0
z2=0
d2=0
x2=df1['xi'][i]-df1['xi'][j+l]
y2=df1['yi'][i]-df1['yi'][j+l]
z2=df1['zi'][i]-df1['zi'][j+l]
d2=math.sqrt((x2**2)+(y2**2)+(z2**2))
x3=0
y3=0
z3=0
d3=0
x3=df1['xi'][j]-df1['xi'][j+l]
y3=df1['yi'][j]-df1['yi'][j+l]
z3=df1['zi'][j]-df1['zi'][j+l]
d3=math.sqrt((x3**2)+(y3**2)+(z3**2))
final=0
final=math.acos(((d2**2)+(d3**2)-(d1**2))/(2*(d2*d3)))
if (final<0.523):
if j not in record:
record.update({j:1})
else :
record[j]=record[j]+1
if i not in record:
record.update({i:1})
else :
record[i]=record[i]+1
count=count+1
flag=1
if (record[j]==4 or record[i]==4):
break
else:
continue