在python中，向cProfile传递函数的正确方法是什么？_Python_Benchmarking_Cprofile

在python中，向cProfile传递函数的正确方法是什么？

python

在python中，向cProfile传递函数的正确方法是什么？,python,benchmarking,cprofile,Python,Benchmarking,Cprofile,我正在尝试使用cProfile和pstats库对我的代码进行基准测试。这是我目前掌握的代码： profile = cProfile.Profile() profile.runcall(gillespie_tau_leaping(propensity_calc, popul_num, LHS, stoch_rate, popul_num_all, tao_all, rxn_vector, delta_t, tao, epsi)) ps = pstats.Stats(profile) ps.prin

我正在尝试使用

cProfile

和

pstats

库对我的代码进行基准测试。这是我目前掌握的代码：

profile = cProfile.Profile()
profile.runcall(gillespie_tau_leaping(propensity_calc, popul_num, LHS, stoch_rate, popul_num_all, tao_all, rxn_vector, delta_t, tao, epsi))
ps = pstats.Stats(profile)
ps.print_stats()

我试图对

gillespie\u tau\u leapping

函数进行基准测试，该函数的输入都是数组，除了

property\u calc

是函数、

epsi

和

delta\u t

是常量

只是目前我得到了以下错误：

File "c:/Users/Mike/visual studio code project/MSc dissertation code/tau_leaping_variant_ssa.py", line 190, in <module>
profile.runcall(gillespie_tau_leaping(propensity_calc, popul_num, LHS, stoch_rate, popul_num_all, tao_all, rxn_vector, delta_t, tao, epsi))
TypeError: 'tuple' object is not callable

文件“c:/Users/Mike/visualstudio代码项目/MSc论文代码/tau_leapping_variant_ssa.py”，第190行，在
配置文件.runcall（gillespie_tau_跳跃（倾向计算、人口数量、LHS、stoch_比率、人口数量、tao_all、rxn_向量、delta_t、tao、epsi））
TypeError:“tuple”对象不可调用

在线

profile.runcall（gillespie\u tau\u跳跃（倾向计算、人口数量、LHS、stoch\u比率、人口数量、tao\u all、rxn\u向量、delta\u t、tao、epsi））

我以前也遇到过类似的问题，我实际上没有将函数作为参数传递，而是调用函数并将结果（元组）传递给内置函数，根据文档，内置函数需要传递函数

这里是不是也有同样的问题，如果是，我该如何解决它（我上次没弄明白）

为此干杯

对于大多数类似函数，您将函数本身（未调用）传递给函数，然后将参数作为参数传递给函数

runcall

；获取

func

，后跟varargs和kwargs（

*args

和

**kwargs

）。您所做的所有更改都是删除函数的调用参数，并在函数后面加一个逗号以将其与其参数分隔开：

profile.runcall(gillespie_tau_leaping, propensity_calc, popul_num, LHS, stoch_rate, popul_num_all, tao_all, rxn_vector, delta_t, tao, epsi)

对于这一点，以及大多数类似的函数，将函数本身（未调用）传递给函数，然后将参数作为参数传递给函数

runcall

；获取

func

，后跟varargs和kwargs（

*args

和

**kwargs

）。您所做的所有更改都是删除函数的调用参数，并在函数后面加一个逗号以将其与其参数分隔开：

profile.runcall(gillespie_tau_leaping, propensity_calc, popul_num, LHS, stoch_rate, popul_num_all, tao_all, rxn_vector, delta_t, tao, epsi)

是否可以

runcall（）

输出到文件？文档中说：“您可以通过为

run（）

函数指定文件名，将结果保存到文件中，而不是在概要文件运行结束时打印输出。”。

runcall（）

是否有类似的功能？文档中几乎没有提到它，两个函数的源代码似乎都没有表明文件路径已被接受。@Kurtheeler:是的，

profile.run

（模块级函数）是对

profile.profile

对象的各种方法的包装。AFAICT，

profile.run

，当传递一个

filename

参数时，大致相当于创建一个

profile.profile

，在其上调用

.run

（不接受

filename

参数），然后在其上调用

.dump\u stats（filename）

。您可以手动执行相同的操作，将

.run

调用替换为

.runcall

调用。是否可以

runcall（）