Python 使用子列表元素的一部分对列表列表进行排序

我有一份清单。每个子列表中的第一个元素是染色体，例如'chr1'，'chr5'，'chr10'，'chrX'和'chrY'。我想按染色体数目，然后按X和Y对子列表进行排序

List.sort(key=lambda x: Set_Chr_Nr_(x[0]))

我使用的是下面的def，它接受染色体字符串，删除'chr'，如果是数字，则将余数转换为int，如果是'X'或'Y'，则对数字进行assign

def Set_Chr_Nr_ (Chr):
    """ Sort by chromosome """
    if Chr: 
        New = Chr[3:]
        if New == 'X': New = 23
        elif New == 'Y': New = 24
        elif New == 'M': New = 25
        else: New = int(New)
    else:
        New = 0
    return New

但它不会返回所需的排序顺序。相反，我得到了一个列表，它以包含“chr1”的子列表开始，但接下来是包含“chr10”的子列表，而不是“chr2”。我做错了什么

具有列标题的示例数据：

Type    OriginChr   OriginBegin OriginEnd   DestChr DestBegin   DestEnd

inversion   chr10   13105010    13105143    chr10   13104876    13105378

inversion   chr14   87902496    87902539    chr14   87902497    87902540

里克

你可以试试

a = ['chr1', 'chr10', 'chr5', 'chrX']
sorted(a, key=lambda x: Set_Chr_Nr_(x))
print a

如果要使用list.sort（），可以切换到

a.sort(lambda x,y: x-y, key=lambda x: Set_Chr_Nr_(x))

对于原始输入，如果列是固定的，这将起作用

a = [['inversion', 'chr14', 87902496, 87902539, 'chr14', 87902497, 87902540], ['inversion', 'chr10', 13105010, 13105143, 'chr10', 13104876, 13105378]]
sorted(a, key=lambda x: Set_Chr_Nr_(x[1]))
print a

你可以试试

a = ['chr1', 'chr10', 'chr5', 'chrX']
sorted(a, key=lambda x: Set_Chr_Nr_(x))
print a

如果要使用list.sort（），可以切换到

a.sort(lambda x,y: x-y, key=lambda x: Set_Chr_Nr_(x))

对于原始输入，如果列是固定的，这将起作用

a = [['inversion', 'chr14', 87902496, 87902539, 'chr14', 87902497, 87902540], ['inversion', 'chr10', 13105010, 13105143, 'chr10', 13104876, 13105378]]
sorted(a, key=lambda x: Set_Chr_Nr_(x[1]))
print a

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为什么不把那份列表也发出来呢。我分析了人类基因组，这些列表往往是巨大的：）@RickTearle发一部分。你可以发一小部分，因为我们需要一些样本输入。另外请注意-

CapWords

通常是为类名保留的，对于大多数使用Python的人来说，将其用于变量会使阅读变得困难。（因此，假设它们是类，甚至会以不同的方式突出显示它们）。为什么不发布列表呢。我分析了人类基因组，这些列表往往非常巨大：）@RickTearle发布其中的一部分。你可以发布其中的一小部分，因为我们需要一些示例输入。还要注意，您应该检查-

CapWords

通常是为类名保留的，而将其用于变量会使大多数使用Python的人很难阅读。（因此，假设它们是类，甚至会以不同的方式突出显示它们）。但是，我将向def传递一个列表，而不是一个包含染色体的字符串？因此，您建议我将列表传递给函数，提取列表中所需的元素，对其进行处理以提取染色体编号，然后返回？为什么这比仅仅将包含染色体的字符串传递给函数更有效？@RickTearle您想对列表进行排序，因此需要传递列表。你可以检查这个url，它告诉你python中排序的几种方法。看看你发布的页面，特别是第一个使用lambda的示例，似乎传递的不是列表，而是列表的一个元素。所以我认为你不必通过一份名单。我在列表的另一个元素上测试了这一点，它是纯数字的，lambda方法对列表进行了正确排序。@RickTearle我有点困惑，例如排序（a，key=lambda x:…），列表a传递给函数sorted，x传递给lambda。我不知道你的意思。但是我正在向def传递一个列表，而不是一个包含染色体的字符串？所以你建议我将列表传递给函数，提取列表中所需的元素，处理它以提取染色体编号，然后返回？为什么这比仅仅将包含染色体的字符串传递给函数更有效？@RickTearle您想对列表进行排序，因此需要传递列表。你可以检查这个url，它告诉你python中排序的几种方法。看看你发布的页面，特别是第一个使用lambda的示例，似乎传递的不是列表，而是列表的一个元素。所以我认为你不必通过一份名单。我在列表的另一个元素上测试了这一点，它是纯数字的，lambda方法对列表进行了正确排序。@RickTearle我有点困惑，例如排序（a，key=lambda x:…），列表a传递给函数sorted，x传递给lambda。我不知道你的存在意味着什么。