Python sql，将从第一个表获得的行值与第二个表的列名（不带循环）匹配

如果有人能解决以下问题，那对我真的很有帮助。我有两张桌子和一张桌子-

必需的SQL脚本：

X1  15.2856
X10 18.2201
X14 13.3406
. .
. .

在不使用循环的情况下，一个高效的SQL脚本将从第一个表获得的行值（sampleID）与第二个表的列名（X2、X4、X8…）匹配，并获得给定Gene_ID（例如NFYA）的值

预期结果：

X1  15.2856
X10 18.2201
X14 13.3406
. .
. .

tableone（行X列：135 X 32）

表说明（部分行和列）

表二（行X列：56000 X 137）

表说明（部分行和列）

用python编写的脚本，模块使用sqlite3

我正在添加完整的代码。如果你能在这里帮助我，那就太好了。提前谢谢

import os, sys, time
import sqlite3   
import apsw  
disk_db = apsw.Connection('sampleinfogenotype.db')  
memcon=apsw.Connection(":memory:")  
with memcon.backup("main",disk_db, "main") as backup:  
    backup.step() # copy whole database in one go  

mdata=memcon.cursor()  
for row in memcon.cursor().execute("SELECT tableone.SampleID from tableone WHERE   tableone.Diagnos=='RH'"):
    sampleID_row=str(row[0])  
    sqlscript="SELECT "+sampleID_row+ " FROM tabletwo WHERE tabletwo.Gene_ID=='NFYA'"  
    data=memdata.execute(sqlscript).fetchall()[0]  
    print sampleID_row,data[0]  
memcon.close()  
disk_db.close()

---

它给出了预期的结果，但它很耗时，因为有一个循环！是否有一个有效的sql脚本或方法…任何信息都会很有帮助..提前感谢

您不需要反复重新查询第二个表，您只需检索一行并将其用作查找表即可。如果使用与检索一行一样简单的：

memcon.row_factory = sqlite3.Row
memdata.execute("select * from tabletwo where tabletwo.Gene_ID == 'NFYA'")
nfya_row = memdata.fetchone()

memdata.execute("SELECT tableone.SampleID from tableone WHERE tableone.Diagnos=='RH'")
for row in memdata:
    sampleID = row['SampleID']
    print sampleID, nfya_row[sampleID]

nfya_行

值现在保存一个

sqlite3.row

对象，其键是列名。现在在

tabelone

results上循环时，您可以直接查找任何给定列的值

如果您使用的是

apsw

模块，则没有简单的现成行工厂返回字典，但您可以轻松地为一行构建字典：

memdata.execute("select * from tabletwo where tabletwo.Gene_ID == 'NFYA'")
nfya_row = {desc[0]: column for desc, column in zip(memdata.getdescription(), memdata.next())}

memdata.execute("SELECT tableone.SampleID from tableone WHERE tableone.Diagnos=='RH'")
for row in memdata:
    sampleID = row[0]
    print sampleID, nfya_row[sampleID]

---

>>感谢Martijn的快速回复…由于我使用apsw模块在内存中调用，我得到一个错误，如下memcon.row_factory=sqlite3.row AttributeError:'apsw.Connection'对象没有属性'row_factory'，我已经编辑了我的问题并添加了完整的代码…如果您能在这里帮助我，那就太好了…提前谢谢@TJC：由于APSW以不同的方式处理行工厂，并且不像sqlite3那样包含一个方便的替代

行

类，我已经更新了我的答案，以包含一个APSW替代项。APSW仍然是一个问题…….AttributeError:'APSW.Cursor'对象没有属性'fetchone'。TJC：很抱歉；将

fetchone（）

替换为

next（）

。我自己从来没有使用过APSW。谢谢@Martijn Pieters。你救了我一天。我是sql的初学者。现在它工作正常了。我对代码“sampleID=row['sampleID']到sampleID=row[0]做了一个小的修改，因为元组索引必须是整数。

memdata.execute("select * from tabletwo where tabletwo.Gene_ID == 'NFYA'")
nfya_row = {desc[0]: column for desc, column in zip(memdata.getdescription(), memdata.next())}

memdata.execute("SELECT tableone.SampleID from tableone WHERE tableone.Diagnos=='RH'")
for row in memdata:
    sampleID = row[0]
    print sampleID, nfya_row[sampleID]