Python 从函数返回的字典为空

我正在编写一个函数，它接收一个可能有多个序列的fasta文件，并返回一个字典，其中登录号作为键，全长头作为值。当我运行函数时，我会得到一个空字典，但当我在函数外运行相同的代码时，我会得到所需的字典。我假设这意味着我的字典在函数中的某个地方被什么都没有覆盖，因为如果它与我的正则表达式模式有关，代码在函数之外也不会工作，但我似乎找不到字典可能被重置的位置。我试着搜索一个解决方案，但我在同一个问题中发现的唯一问题都有明显的问题（没有返回值或其中一个输入变量被覆盖）

这是我的函数代码和输出（假设已导入re）：

输出

{}

{'AF12345': '>AF12345 test sequence 1'}

以下是我在函数外部运行时的输入/输出：

import re
file = open("seq1.txt", "r")
head_dict = {}

for line in file:
    if line.startswith(">"):
        key = re.search(">([^\s]+)", line).group(1)
        value = line.rstrip()
        head_dict[key] = value


print(head_dict)

输出

{}

{'AF12345': '>AF12345 test sequence 1'}

其中seq1.txt是以下没有引号的文件，并且txt文件有一个实际返回值而不是“\n”，我只是不确定如何正确格式化它

“>AF12345测试序列1\nCGATATTCCCATGCGGTTATTTATGTCAAACTGTGACGTTCGCTTGA”

上面是我的代码现在所在的位置。在此之前，我有一个函数，它创建了两个字典，并根据输入参数返回了一个特定的字典。一本字典是登录号和序列，另一本是我正在创建的字典。我把第一本字典拿回来没有任何问题。因此，我决定拆分函数，并为每个字典设置一个函数，尽管它看起来很重复。我还尝试将

head\u dict[key]=value

移动到条件语句之外，并遇到了同样的问题。我尝试将变量名从

key

更改为

acc

，从

value

更改为

header

，但仍然得到了相同的结果（在我的示例中，您可以看到函数外部的变量最初是

key

和

value

）。我只是尝试将空字典设置为参数，以便在函数外部对其进行初始化，但仍然返回了一个空字典。我不知道现在该试什么。提前谢谢

注意：我相信这可以通过另一个库更有效地解决，但这是针对一个类的，讲师非常反对使用其他库。我们必须先学会自己做这件事

编辑：现在我很沮丧。我重写了代码，添加了创建输入文件的功能，供人们运行我的代码并帮助我使用，但它可以工作。我很抱歉浪费了大家的时间。这是我重写的。如果你注意到这和我上面发布的内容有差异，请让我知道

import re
def getheader(file):
    '''
    compiles headers from a fasta file into a dictionary

    Parameters
    ----------
    file : file
        file that contains the sequences with headers and has not been read

    Returns
    -------
    dictionary with acc no as key and full header as value

    '''
    head_dict = {}
    
    for line in file:
        if line.startswith(">"):
            acc = re.search(">([^\s]+)", line).group(1)
            header = line.rstrip()
            head_dict[acc] = header
            
    return head_dict

file = open("bookishbubs_test1.txt", "w")
file.write(">AF12345 test sequence 1\nCGATATTCCCATGCGGTTTATTTATGCAAAACTGTGACGTTCGCTTGA")
file.close()

file = open("bookishbubs_test1.txt", "r")
headers = getheader(file)
print(headers)
file.close()

---

请将您如何使用该功能添加到您的@第二次世界大战是不是帮你修好了这个缩进地址？现在，您应该能够看到调用函数的代码位，这就是我认为您所要求的。它应该可以工作。除非输入文件是错误的。只需传递一个硬编码的文件行列表，就可以创建一个文件行，这样人们就可以在家里复制它了我想出来了！我意识到我将文件拉入函数的方式肯定有问题，所以这给了我一个新的短语，谷歌。问题是我调用了两次函数。所以当我第二次调用它时，文件已经被读取，指针在文件的末尾。我在函数开头添加了一行重置指针，请将您使用函数的方式添加到您的@第二次世界大战是不是帮你修好了这个缩进地址？现在，您应该能够看到调用函数的代码位，这就是我认为您所要求的。它应该可以工作。除非输入文件是错误的。只需传递一个硬编码的文件行列表，就可以创建一个文件行，这样人们就可以在家里复制它了我想出来了！我意识到我将文件拉入函数的方式肯定有问题，所以这给了我一个新的短语，谷歌。问题是我调用了两次函数。所以当我第二次调用它时，文件已经被读取，指针在文件的末尾。我在函数的开头添加了一行重置指针