使用Nipy在python中下载mri T1图像示例
我有一个T1图像(NIFTI),已经对齐,尺寸为121 x 145 x 121。使用Nipy在python中下载mri T1图像示例,python,image-processing,neuroscience,nipype,nibabel,Python,Image Processing,Neuroscience,Nipype,Nibabel,我有一个T1图像(NIFTI),已经对齐,尺寸为121 x 145 x 121。 图像由nibabel加载。体素大小为1.5 x 1.5 x 1.5 mm。 我想将其向下采样为分辨率为2.0 x 2.0 x 2.0 mm的图像,并保持图像对齐 我对MRI图像处理知之甚少。 我找不到清晰的教程 我该怎么做? 如果您知道任何其他Python库可以做到这一点,那么它也可以工作。我建议使用Nibabel。它可以在几行内对nifti文件进行下采样。 将图像重采样为2x2x2的体素大小的示例: import
图像由nibabel加载。体素大小为1.5 x 1.5 x 1.5 mm。
我想将其向下采样为分辨率为2.0 x 2.0 x 2.0 mm的图像,并保持图像对齐 我对MRI图像处理知之甚少。 我找不到清晰的教程 我该怎么做?
如果您知道任何其他Python库可以做到这一点,那么它也可以工作。我建议使用Nibabel。它可以在几行内对nifti文件进行下采样。
将图像重采样为2x2x2的体素大小的示例:
import nibabel
import nibabel.processing
input_path = r'/input/path/input_img.nii.gz'
output_path = r'/output/path/output_img.nii.gz'
voxel_size = [2, 2, 2]
input_img = nibabel.load(input_path)
resampled_img = nibabel.processing.resample_to_output(input_img, voxel_size)
nibabel.save(resampled_img, output_path)
只需更新input\u path
和output\u path
即可反映您的文件。重采样到输出函数(voxel\u size
)中的第二个参数需要与输入的尺寸相匹配,或者是一个单一的值。然后,nibabel将假定所有尺寸都需要相同的体素尺寸
Nibabel信息:文件:
安装说明:您能告诉我如何使用Python查找MRI图像的模态吗?你能帮我做这个吗?亚历克斯-你能帮我写这篇文章吗?