R 使用is.na作为索引速度较慢

我是新手（有MatLab经验）。我仍在探索语法，并学习以一种更具创造性的方式思考

我在data.frame类中有一些数据（3000 x 3000），下面的代码似乎执行得非常慢

data[is.na(data)] = 0 

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我想从一些有经验的用户那里得到一些评论。谢谢

假设您正试图用

0

替换

NA

，并且您拥有所有数字，请使用矩阵

x <- matrix(runif(9e+06,0,100),ncol=3000)
x[x <= 55 & x >= 54] <- NA
table(is.na(x))
  FALSE    TRUE 
8910086   89914
x[is.na(x)] <- 0
table(is.na(x))
  FALSE 
9000000

---

x您是否正在尝试将
NA
转换为
0
？在没有看到您的代码的情况下，很难做到精确，但一个常见的错误是在您真正需要
矩阵时使用
data.frame
。如果所有内容都是数字（或整数），则速度会快得多。否则，请尝试仅对需要它的列执行此操作，ala
data[is.na（data[，2]），2]=0
。列类是什么？它们都是数值的吗？@JeremyS-是的，我正在尝试将NA转换为0。@RichardScriven-所有列都是数值的以前花了多长时间？这对我来说并没有改变x。如果我这样做的话，
is.na（x）@JeremyS你是对的<代码>is.na
system.time(is.na(x) <- 0)
user  system elapsed 
0.024   0.044   0.068 # yes faster
table(is.na(x))
FALSE    TRUE 
8909945   90055 # doesn't change x
system.time(x[is.na(x)] <- 0)
user  system elapsed 
0.252   0.032   0.287 # slower
table(is.na(x))
FALSE 
9000000 # changes x