在计算集群上并行运行linux上的R代码

我最近将我的windows R代码转换为Linux安装，以便在函数上运行DEoptim。在我的windows系统上，使用以下各项都可以正常工作：

ans <- DEoptim1(Calibrate,lower,upper,
                DEoptim.control(trace=TRUE,parallelType=1,parVAr=parVarnames3,
                                packages=c("hydromad","maptools","compiler","tcltk","raster")))

无论我尝试和回忆什么包，都会复制此错误，即使

library(raster)

命令运行良好，当我使用以下命令调用所有库时，“光栅”清楚地显示为OK：

library()

所以，我的直觉是，即使所有的包和库都加载正常，这是因为我使用了一个个人库，DEoptim.control的packages元素在另一个空间中查看。以下是如何安装软件包的示例：

install.packages("/home/antony/R/Pkges/raster_2.4-15.tar.gz",rpeo=NULL,target="source",lib="/home/antony/R/library")

我还设置了lib path选项，如下所示：

.libPaths('/home/antony/R/library')

有人知道我做错了什么，以及如何在DEoptim控件中设置“packages”选项，以便我可以在多个内核上并行运行DEoptim吗

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非常感谢，安东尼

我纠正了一个打字错误。请确认错误不是由它引起的。未在工作程序上加载包。根据

DEoptim1

所使用的并行框架，有不同的修复方法。您可能需要

clusterEvalQ

来调用所有Worker上的

library

。感谢您的建议-我通过加载到默认库而不是我自己的库来修复此问题。工作人员似乎需要查看默认的库空间。

.libPaths('/home/antony/R/library')