R 进行生存分析时出现log2问题

我计划使用TCGAbiolinks通过使用以下代码执行生存分析：

library(TCGAbiolinks)
library(SummarizedExperiment)
query_RNAseq <- GDCquery(project = "TCGA-PAAD",
                         data.category = "Gene expression",
                         data.type = "Gene expression quantification",
                         platform = "Illumina HiSeq", 
                         file.type  = "results",
                         experimental.strategy = "RNA-Seq",
                         legacy = TRUE)
GDCdownload(query_RNAseq, method = "api",chunks.per.download = 10) 
PAADRnaseqSE <- GDCprepare(query_RNAseq)

# Survival Analysis SA
clinical_patient_Cancer <- GDCquery_clinic("TCGA-PAAD","clinical")
dataPAADcomplete <- log2(PAADRnaseqSE)

库（TCGAbiolinks）
图书馆（总结实验）
查询\u RNAseq代码来自哪里？你期望最后一行做什么
log2（）
对数字有效，而
paddrnase
是一个复杂的数据结构…只是猜测，但是
log2（as.numeric（PAADRnaseqSE））
有效吗？@Ben Bolkeryes，谢谢，我使用SummaredExperiment包中的分析功能将
PadRNaseqse
转换为矩阵后解决了这个问题：
PadMatrix@Mist，它不起作用，但我已经解决了这个问题。谢谢你的提示
> dataPAADcomplete <- log2(PAADRnaseqSE)
Error in log(<S4 object of class "RangedSummarizedExperiment">, 2) : 
  unused argument (2)