RStudio（windows）的knitr编译问题

我有一个基于knitr的Rnw文件，它在mac（v0.97.316）和knitr（v1.1）上的RStudio中编译为pdf格式，但在windows环境（相同版本）中，我得到了一个编译错误。我已经在两种环境中检查了RStudio中的选项，它们是一致的

windows安装程序似乎总是将“\SweaveOpts{concordance=TRUE}”注入到“.tex”文件中，即使我在Rnw文件中没有这样的标志，和/或如果我在首选项中切换设置，和/或如果我将“opts_knit$set（concordance=FALSE）”选项添加到knitr设置块中。如果我从“.tex”文件中删除该行，并在cmd提示符下手动编译它，则会按预期生成输出

我不确定这是否是一个RStudio或knitr问题，但任何指点都将不胜感激

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注意，我也在RStudio支持板（）上发布了这个问题。

它注入

\SweaveOpts{concordance=TRUE}

的原因很可能是你的编织者是

Sweave

，而不是

knitr

，您还启用了Rnw concordance：但我不能肯定它对于Windows版本的RStudio来说不是一个bug。无论如何，很容易验证这是否是RStudio问题——打开

编译PDF

面板，您应该会看到如下日志：

如果你的织工是瑞典人，你会看到类似的东西：

这是我的配置（我在Ubuntu下）：

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如果您确实在使用

knitr

，而RStudio仍然插入

\swaveopts{concordance=TRUE}

，我想这一定是RStudio的一个bug。

即使默认情况下为“Weave Rnw files using”设置了

knitr

，我也会遇到同样的问题

我通过转到Tools/Global Options/swave并将“Weave Rnw files using”设置为

swave

，然后按

Ok

，解决了这个问题。然后，我返回并将其设置回

knitr

，现在一切正常

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我想这确实是Rstudio的错误

我在2016-04-24下载的“R CMD build KFAS master”中遇到了这个问题，在GitHub（）上单击KFAS的“Download zip”（下载zip）作为“KFAS master.zip”）。我无法复制该问题，但我使用的解决方法是找到弹出窗口中提到的行（复制如下），并在其前面加上“%%”进行注释

下载后，我将其解压缩，并将文件夹名称更改为“KFAS”。然后，我得到一个命令提示符，并导航到包含重命名为KFAS的KFAS主文件夹的目录。这次“R CMD build KFAS”按预期工作。然后我在RStudio 0.99.893中打开了~KFAS/vignettes/KFAS.Rmw，这是2016-04-26的当前版本。我更改了一些内容并保存了结果。当我重复“R CMD build KFAS”时，我得到了下图所示的问题

Jouni Helske把我引向这篇文章。我通过在“\sWaveOpts{concordance=TRUE}”前面加上“%%”，注释掉了下面屏幕截图中提到的第69行。我保存了结果，“R CMD build KFAS”有效

有些东西似乎偶尔会在*.Rnw文件中插入一行，如“\SweaveOpts{concordance=TRUE}”，但我不知道它是什么。我正在MacBookPro上运行R3.2.4，操作系统为X10.11.2

感谢Yihui和其他人在本帖中的早期帖子

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谢谢您的回复，但我已经激活了knitr设置，日志的第一部分确认knitr将被使用。实际上，看起来好像是我没有在Rnw文件中发现这一行，在切换环境时必须添加这一行。