将CSV从github读入R

我正在尝试将CSV从github读入R:

latent.growth.data <- read.csv("https://github.com/aronlindberg/latent_growth_classes/blob/master/LGC_data.csv")

我尝试了

？read.csv

，

？download.file

，

getURL

（它只返回奇怪的HTML）以及，但仍然无法理解如何使它工作

---

我做错了什么？

来自

url

的文档：

download.file("https://raw.github.com/aronlindberg/latent_growth_classes/master/LGC_data.csv", 
    destfile = "/tmp/test.csv", method = "curl")

请注意，不支持“https://”连接（某些 Windows上的异常）

所以问题是R不允许连接到

https

URL

您可以将

download.file

与

curl

一起使用：

download.file("https://raw.github.com/aronlindberg/latent_growth_classes/master/LGC_data.csv", 
    destfile = "/tmp/test.csv", method = "curl")

试试这个：

library(RCurl)
x <- getURL("https://raw.github.com/aronlindberg/latent_growth_classes/master/LGC_data.csv")
y <- read.csv(text = x)

库（RCurl）
x我使用的是r3.0.2，这段代码完成了这项工作

urlfile<-'https://raw.github.com/aronlindberg/latent_growth_classes/master/LGC_data.csv'
dsin<-read.csv(urlfile)

这就是我一直在帮助力拓发展的原因。它基本上是一个通用数据导入/导出包，支持HTTPS/SSL，并从其扩展名推断文件类型，因此允许您使用一个导入功能基本上读取任何内容：

library("rio")

如果您从Github获取CSV的“原始”url，您可以使用
导入
将其加载一行：

import("https://raw.githubusercontent.com/aronlindberg/latent_growth_classes/master/LGC_data.csv")

结果是一个data.frame：

     top100_repository_name   month monthly_increase monthly_begin_at monthly_end_with
1                    Bukkit 2012-03                9              431              440
2                    Bukkit 2012-04               19              438              457
3                    Bukkit 2012-05               19              455              474
4                    Bukkit 2012-06               18              475              493
5                    Bukkit 2012-07               15              492              507
6                    Bukkit 2012-08               50              506              556
...

意识到这个问题已经很老了，谷歌仍将其列为最重要的结果（至少对我而言），因此我决定在2015年提供答案

人们现在通常会迁移到
curl
包（包括著名的
httr
），它提供了以下非常简单的解决方案：

library(curl)

x <- read.csv( curl("https://raw.githubusercontent.com/trinker/dummy/master/data/gcircles.csv") )

库（curl）
xcurl可能在windows中不起作用，至少对我来说是这样

这就是我在Windows中的工作原理

download.file（“https://github.com/aronlindberg/latent_growth_classes/master/LGC_data.csv", 
destfile=“/tmp/test.csv”，method=“wininet”）

在Linux中

download.file（“https://github.com/aronlindberg/latent_growth_classes/master/LGC_data.csv", 
destfile=“/tmp/test.csv”，method=“curl”）
与akhmed的风格类似，我想我会更新答案，因为现在您可以使用Hadley的
readr
软件包。
只需注意一件事：您需要将url作为raw内容（请参阅下面的
//raw.git…
）。
下面是一个例子：

library(readr)
data <- read_csv("https://raw.githubusercontent.com/RobertMyles/Bayesian-Ideal-Point-IRT-Models/master/Senate_Example.csv")

库（readr）
数据一种相当虚假的方式。。。使用“从剪贴板复制/粘贴”

x <- read.table(file = "clipboard", sep = "t", header=TRUE)

x似乎现在GitHub希望您通过他们的API获取内容。我使用的软件包如下：

require（gh）
tmp=tempfile（）
库尔https://raw.githubusercontent.com/aronlindberg/latent_growth_classes/master/LGC_data.csv'
#下载
gh（粘贴0（'GET'，qurl），.destfile=tmp，.overwrite=TRUE）
#阅读
read.csv（tmp）

重要的部分是您提供个人访问令牌（PAT）。通过
gh（.token=）
参数，或者像我那样，在
~/.Renviron
文件[1]中全局设置PAT。当然，您首先必须在自己的位置创建PAT

[1] 
~/.Renviron
，我想所有包都会首先搜索它，就像一个包一样。其中的令牌应如下所示：

GITHUB_PAT = "XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX"


您也可以使用该包设置PAT。
正如其他帖子所提到的，只需转到github上原始代码的链接即可

例如：

x@DirkEddelbuettel虽然它确实依赖于安装Curl，但引用自
？url
：请注意，除Windows外，不支持“https://”url方案。如何解决函数中的
错误（type，msg，asError=TRUE）：SSL证书问题：无法获取本地颁发者证书
？出于内存/空间的目的，也可以作为一行写入：
y我尝试了此操作，但无效
x@Ben10，您没有使用原始URL。你能试试看它是否有效吗？我试了一下，得到了
get\u ext（file）：file没有扩展名
@Adrian在最新的Github版本中有一个小的打字错误。从CRAN安装旧版本或从Github重新安装，它应该适合您。谢谢-问题已经解决。您的解决方案是唯一适合我的解决方案（Windows 8.1）
x <- read.table(file = "clipboard", sep = "t", header=TRUE)

GITHUB_PAT = "XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX"