三维曲面,在r中绘制,具有x、y、z坐标
我试图使用3D曲面图来分析作为输入函数的结果稳定性。z是我的结果,x和y是参数值。使用lattice的线框,我可以制作一个曲面图,这没有问题,但是拥有plotly的交互式和可共享功能会很好。火山的例子没有显示如何获取x、y、z坐标并绘制曲面图。有人知道如何简洁地做到这一点吗?以下是晶格线框示例和数据:三维曲面,在r中绘制,具有x、y、z坐标,r,plot,3d,data.table,plotly,R,Plot,3d,Data.table,Plotly,我试图使用3D曲面图来分析作为输入函数的结果稳定性。z是我的结果,x和y是参数值。使用lattice的线框,我可以制作一个曲面图,这没有问题,但是拥有plotly的交互式和可共享功能会很好。火山的例子没有显示如何获取x、y、z坐标并绘制曲面图。有人知道如何简洁地做到这一点吗?以下是晶格线框示例和数据: library(lattice) z <- c(0.035, 0.043, 0.036, 0.037, 0.016, 0.013, 0.025, 0.037, 0.039, 0.043,
library(lattice)
z <- c(0.035, 0.043, 0.036, 0.037, 0.016, 0.013, 0.025, 0.037, 0.039, 0.043,
0.049, 0.029, 0.025, 0.02, 0.032, 0.045, 0.049, 0.043, 0.027, 0.031,
0.028,0.039, 0.038, 0.037, 0.045, 0.046, 0.04, 0.041, 0.037, 0.048, 0.048,
0.032, 0.03, 0.032, 0.029, 0.043, 0.056, 0.057, 0.046, 0.034, 0.035,
0.026,0.036, 0.048, 0.038, 0.032, 0.034, 0.027, 0.024, 0.041, 0.05, 0.056,
0.038, 0.027, 0.034, 0.027, 0.042, 0.054, 0.054, 0.039, 0.036, 0.029,
0.027,0.04, 0.052, 0.058, 0.051, 0.028, 0.025, 0.035, 0.037, 0.053, 0.059,
0.049, 0.044, 0.035, 0.021, 0.044, 0.059, 0.054, 0.052, 0.041, 0.032,
0.036,0.039, 0.051, 0.056, 0.038, 0.04, 0.022, 0.015, 0.043, 0.054, 0.052,
0.05, 0.031, 0.03, 0.03, 0.031, 0.044, 0.051, 0.047, 0.04, 0.038,
0.037,0.06, 0.071, 0.07, 0.066, 0.038, 0.031, 0.045, 0.064, 0.065, 0.074,
0.08, 0.052, 0.048, 0.041, 0.053, 0.072, 0.079, 0.071, 0.043, 0.059, 0.05,
0.061, 0.061, 0.055, 0.069, 0.07, 0.057, 0.057, 0.055, 0.074, 0.071, 0.051,
0.048, 0.05, 0.053, 0.069, 0.086, 0.085, 0.07, 0.047, 0.05, 0.047,0.055,
0.073, 0.065, 0.056, 0.054, 0.048, 0.043, 0.063, 0.078, 0.087, 0.068, 0.047,
0.052, 0.048, 0.065, 0.085, 0.084, 0.062, 0.049, 0.05, 0.05, 0.068, 0.084,
0.095, 0.089, 0.052, 0.052, 0.062, 0.062, 0.086, 0.09, 0.078, 0.062, 0.058,
0.038, 0.068, 0.095, 0.09, 0.082, 0.069, 0.057, 0.058,0.064, 0.082, 0.087,
0.055, 0.053, 0.032, 0.033, 0.067, 0.087, 0.087, 0.079, 0.058, 0.053, 0.057,
0.047, 0.069, 0.085, 0.075, 0.068, 0.063, 0.062,0.076, 0.089, 0.095, 0.086,
0.056, 0.053, 0.063, 0.082, 0.08, 0.099, 0.101, 0.067, 0.065, 0.058, 0.066,
0.086, 0.103, 0.088, 0.051, 0.072, 0.06, 0.08, 0.078, 0.067, 0.084, 0.086,
0.067, 0.066, 0.068, 0.087, 0.087, 0.071, 0.063, 0.065, 0.067, 0.087, 0.104,
0.108, 0.086, 0.057, 0.063, 0.056,0.064, 0.087, 0.084, 0.07, 0.063, 0.061,
0.06, 0.076, 0.095, 0.11, 0.088, 0.057, 0.062, 0.067, 0.079, 0.097, 0.105,
0.079, 0.055, 0.064, 0.066,0.087, 0.104, 0.12, 0.113, 0.063, 0.07, 0.075,
0.073, 0.104, 0.111, 0.091, 0.072, 0.07, 0.05, 0.083, 0.114, 0.11, 0.098,
0.083, 0.077, 0.07, 0.078, 0.098, 0.105, 0.069, 0.062, 0.045, 0.046, 0.083,
0.106, 0.106, 0.093, 0.077, 0.075, 0.073, 0.057, 0.088, 0.105, 0.094, 0.084,
0.082, 0.081)
x <- c(1, 4, 7, 10, 13, 16, 19, 1, 4, 7, 10, 13, 16, 19, 1, 4, 7,
10, 13, 16, 19, 1, 4, 7, 10, 13, 16, 19, 1, 4, 7, 10,13, 16, 19, 1,
4, 7, 10, 13, 16, 19, 1, 4, 7, 10, 13, 16, 19, 1, 4, 7, 10, 13, 16,
19, 1, 4, 7, 10, 13, 16, 19, 1, 4, 7, 10, 13, 16, 19, 1, 4, 7, 10,
13, 16, 19, 1, 4, 7, 10, 13, 16, 19, 1, 4, 7, 10, 13, 16, 19, 1, 4,
7, 10, 13, 16, 19, 1, 4, 7, 10, 13, 16, 19, 1, 4, 7, 10, 13, 16, 19,
1, 4, 7, 10, 13, 16, 19, 1, 4, 7, 10, 13, 16, 19, 1, 4, 7, 10, 13,
16, 19, 1, 4, 7, 10, 13, 16, 19, 1, 4, 7, 10, 13, 16, 19, 1, 4, 7,
10, 13, 16, 19, 1, 4, 7, 10, 13, 16, 19, 1, 4, 7, 10, 13, 16, 19, 1,
4, 7, 10, 13, 16, 19, 1, 4, 7, 10, 13, 16, 19, 1, 4, 7, 10, 13, 16,
19, 1, 4, 7, 10, 13, 16, 19, 1, 4, 7, 10, 13, 16, 19, 1, 4, 7, 10,
13, 16, 19, 1, 4, 7, 10, 13, 16, 19, 1, 4, 7, 10, 13, 16, 19,1, 4,
7, 10, 13, 16, 19, 1, 4, 7, 10, 13, 16, 19, 1, 4, 7, 10, 13, 16, 19,
1, 4, 7, 10, 13, 16, 19, 1, 4, 7, 10,13, 16, 19, 1, 4, 7, 10, 13,
16, 19, 1, 4, 7, 10, 13, 16, 19, 1, 4, 7, 10, 13, 16, 19, 1, 4, 7,
10, 13, 16, 19, 1, 4, 7, 10, 13, 16, 19, 1, 4, 7, 10, 13, 16, 19, 1,
4, 7, 10, 13, 16, 19, 1, 4, 7, 10, 13, 16, 19)
y <- c(0.1, 0.1, 0.1, 0.1, 0.1, 0.1, 0.1, 0.1, 0.1, 0.1, 0.1, 0.1, 0.1,
0.1, 0.1, 0.1, 0.1, 0.1, 0.1, 0.1, 0.1, 0.1, 0.1, 0.1, 0.1, 0.1, 0.1,
0.1,0.1, 0.1, 0.1, 0.1, 0.1, 0.1, 0.1, 0.1, 0.1, 0.1, 0.1, 0.1, 0.1, 0.1,
0.1, 0.1, 0.1, 0.1, 0.1, 0.1, 0.1, 0.1, 0.1, 0.1, 0.1, 0.1, 0.1, 0.1, 0.1,
0.1, 0.1, 0.1, 0.1, 0.1, 0.1, 0.1, 0.1, 0.1, 0.1, 0.1, 0.1, 0.1, 0.1, 0.1,
0.1, 0.1, 0.1, 0.1, 0.1, 0.1, 0.1, 0.1, 0.1, 0.1, 0.1, 0.1, 0.1, 0.1, 0.1,
0.1, 0.1, 0.1, 0.1, 0.1, 0.1, 0.1, 0.1, 0.1, 0.1, 0.1, 0.1, 0.1, 0.1, 0.1,
0.1, 0.1, 0.1, 0.2, 0.2, 0.2, 0.2, 0.2, 0.2, 0.2, 0.2, 0.2, 0.2, 0.2, 0.2,
0.2, 0.2, 0.2, 0.2, 0.2, 0.2, 0.2, 0.2, 0.2, 0.2, 0.2, 0.2, 0.2, 0.2, 0.2,
0.2, 0.2, 0.2, 0.2, 0.2, 0.2, 0.2, 0.2, 0.2, 0.2, 0.2, 0.2, 0.2, 0.2, 0.2,
0.2, 0.2, 0.2, 0.2, 0.2, 0.2, 0.2, 0.2, 0.2, 0.2, 0.2, 0.2, 0.2, 0.2, 0.2,
0.2, 0.2, 0.2, 0.2, 0.2, 0.2, 0.2, 0.2, 0.2, 0.2, 0.2, 0.2, 0.2, 0.2, 0.2,
0.2, 0.2, 0.2, 0.2, 0.2, 0.2, 0.2, 0.2, 0.2, 0.2, 0.2, 0.2, 0.2, 0.2, 0.2,
0.2, 0.2, 0.2, 0.2,0.2, 0.2, 0.2, 0.2, 0.2, 0.2, 0.2, 0.2, 0.2, 0.2, 0.2,
0.2, 0.2, 0.2, 0.3, 0.3, 0.3, 0.3, 0.3, 0.3, 0.3, 0.3, 0.3, 0.3, 0.3, 0.3,
0.3, 0.3, 0.3, 0.3, 0.3, 0.3, 0.3, 0.3, 0.3, 0.3, 0.3, 0.3, 0.3, 0.3, 0.3,
0.3, 0.3, 0.3, 0.3, 0.3, 0.3, 0.3, 0.3, 0.3, 0.3, 0.3, 0.3, 0.3, 0.3,
0.3,0.3, 0.3, 0.3, 0.3, 0.3, 0.3, 0.3, 0.3, 0.3, 0.3, 0.3, 0.3, 0.3, 0.3,
0.3, 0.3, 0.3, 0.3, 0.3, 0.3, 0.3, 0.3, 0.3, 0.3, 0.3, 0.3, 0.3, 0.3, 0.3,
0.3, 0.3, 0.3, 0.3, 0.3, 0.3, 0.3, 0.3, 0.3, 0.3, 0.3, 0.3, 0.3, 0.3, 0.3,
0.3, 0.3, 0.3, 0.3, 0.3, 0.3, 0.3, 0.3, 0.3, 0.3, 0.3, 0.3, 0.3, 0.3, 0.3,
0.3, 0.3, 0.3, 0.3)
wireframe(z ~ x * y, xlab="Parameter 1", ylab="Parameter 2", zlab="Fitness Value")
库(晶格)
类似这样的东西效果很好。这是你想要的吗
library(plotly)
data <- data.frame(x=x,y=y,z=z)
plot_ly() %>%
add_trace(data = data, x=data$x, y=data$y, z=data$z, type="mesh3d" )
library(plotly)
数据%
添加_跟踪(数据=数据,x=数据$x,y=数据$y,z=数据$z,type=“mesh3d”)
查看Github上的讨论,Plotly曲面三角剖分可以做什么和不能做什么:
简单地说,问题是3D Delauney三角剖分,该剖分是在没有i、j、k坐标和alphahull
值的情况下使用绘图默认参数完成的
为了将三维曲面打印为实际三维曲面,而不使用三维Delauney三角剖分产生的其他面,需要执行以下操作:
将点投影到xy平面上,并通过python中的scipy.spatial.Delaunay
对生成的2d点进行三角剖分。在R中,我想你可以使用delaunayn
。此包与scipy.spatial
然后,将三角剖分提升到三维空间,请参见中的示例以及链接github问题中plotly 3d surface能够直接实现的功能的详细说明
我不太清楚,但仅供参考,data.table支持df.ex[,线框(Output~Input1*Input2)]之类的语法,也就是说,您可以跳过$。这很有效!add_surface()和add_trace()之间有什么区别?我对OP也有类似的问题,因为我也认为添加_surface()是一种方法。有没有一种方法可以消除数据范围边缘的奇怪平面?也就是说,在上图中,驼峰顶部和最右上角的数据点之间有一个较暗的三角形。这不是实际数据的一部分,但mesh3d出于某种原因添加了它。回答得好@Edgar Santos!我很想用我的数据做同样的尝试。如果你有时间的话,你能看一下这个问题吗?非常感谢。
df.ex <- data.table(Output=z,Input1=x,Input2=y,Input3=rnorm(315),Input4 =
abs(rnorm(315)+.5))
wireframe(df.ex$Output ~ df.ex$Input1 * df.ex$Input2)
library(plotly)
data <- data.frame(x=x,y=y,z=z)
plot_ly() %>%
add_trace(data = data, x=data$x, y=data$y, z=data$z, type="mesh3d" )