使用R中的IF语句为数值变量赋值
我有一个函数可以计算两个数据集中的行(基于相同的列)之间的差异。下面是一个示例和函数使用R中的IF语句为数值变量赋值,r,if-statement,na,R,If Statement,Na,我有一个函数可以计算两个数据集中的行(基于相同的列)之间的差异。下面是一个示例和函数 ################# ## Sample ## ################# # data frame for recipients IDr= c(seq(1,4)) Blood_type_r=c("A","B","AB","O") data_R=data.frame(IDr,Blood_type_
#################
## Sample ##
#################
# data frame for recipients
IDr= c(seq(1,4))
Blood_type_r=c("A","B","AB","O")
data_R=data.frame(IDr,Blood_type_r,A=rep(0,4),B=c(rep(0,3),1),C=c(rep(1,3),0),D=rep(1,4),E=c(rep(0,2),rep(1,1),0),stringsAsFactors=FALSE)
data_R
IDr Blood_type_r A B C D E
1 1 A 0 0 1 1 0
2 2 B 0 0 1 1 0
3 3 AB 0 0 1 1 1
4 4 O 0 1 0 1 0
# data frame for donors
IDd= c(seq(1,8))
Blood_type_d= c(rep("A", each=2),rep("B", each=2),rep("AB", each=2),rep("O", each=2))
WD= c(rep(0.25, each=2),rep(0.125, each=2),rep(0.125, each=2),rep(0.5, each=2))
data_D=data.frame(IDd,Blood_type_d,A=c(rep(0,6),1,1),B=c(rep(0,6),1,1),C=c(rep(1,7),0),D=rep(1,8),E=c(rep(0,6),rep(1,1),0),WD,stringsAsFactors=FALSE)
data_D
IDd Blood_type_d A B C D E WD
1 1 A 0 0 1 1 0 0.250
2 2 A 0 0 1 1 0 0.250
3 3 B 0 0 1 1 0 0.125
4 4 B 0 0 1 1 0 0.125
5 5 AB 0 0 1 1 0 0.125
6 6 AB 0 0 1 1 0 0.125
7 7 O 1 1 1 1 1 0.500
8 8 O 1 1 0 1 0 0.500
# function
soustraction.i=function(D,R,i,threshold){
D=as.data.frame(D)
R=as.data.frame(R)
dif=map2_df(D, R[i,], `-`)
dif[dif<0] = 0
dif$mismatch=rowSums(dif)
dif=dif[which(dif$mismatch <= threshold),]
return(dif)
}
soustraction.i(data_D[,3:7],data_R[,3:7],1,3)
# A tibble: 8 x 6
A B C D E mismatch
<dbl> <dbl> <dbl> <dbl> <dbl> <dbl>
1 0 0 0 0 0 0
2 0 0 0 0 0 0
3 0 0 0 0 0 0
4 0 0 0 0 0 0
5 0 0 0 0 0 0
6 0 0 0 0 0 0
7 1 1 0 0 1 3
8 1 1 0 0 0 2
我失去了2名患者,我希望分配一个NA
值。因此,输出将是
# Desired output
# A tibble: 8 x 6
A B C D E mismatch
<dbl> <dbl> <dbl> <dbl> <dbl> <dbl>
1 0 0 0 0 0 0
2 0 0 0 0 0 0
3 0 0 0 0 0 0
4 0 0 0 0 0 0
5 0 0 0 0 0 0
6 0 0 0 0 0 0
7 1 1 0 0 1 NA
8 1 1 0 0 0 NA
#所需输出
#一个tibble:8x6
A、B、C、D、E不匹配
1 0 0 0 0 0 0
2 0 0 0 0 0 0
3 0 0 0 0 0 0
4 0 0 0 0 0 0
5 0 0 0 0 0 0
6 0 0 0 0 0 0
711001NA
81100NA
这是我迄今为止所做的尝试,它给了我一个警告,并没有做正确的事情
soustraction.j=function(D,R,i,threshold){
D=as.data.frame(D)
R=as.data.frame(R)
dif=map2_df(D, R[i,], `-`)
dif[dif<0] = 0
dif$mismatch=rowSums(dif)
if(threshold==0){
if(dif$mismatch > 0){
dif$mismatch= NA
}
}else{
dif=dif[which(dif$mismatch <= threshold),]
}
return(dif)
}
soustraction.j(data_D[,3:7],data_R[,3:7],1,0)
# A tibble: 8 x 6
A B C D E mismatch
<dbl> <dbl> <dbl> <dbl> <dbl> <dbl>
1 0 0 0 0 0 0
2 0 0 0 0 0 0
3 0 0 0 0 0 0
4 0 0 0 0 0 0
5 0 0 0 0 0 0
6 0 0 0 0 0 0
7 1 1 0 0 1 3
8 1 1 0 0 0 2
#Warning message:
#In if (dif$mismatch > 0) { :
# the condition has length > 1 and only the first element will be used
soutraction.j=函数(D,R,i,阈值){
D=as.data.frame(D)
R=as.data.frame(R)
dif=map2_-df(D,R[i,],`-`)
dif[dif 0){
dif$不匹配=NA
}
}否则{
dif=dif[其中(dif$0){:
#条件的长度大于1,并且只使用第一个元素
提前感谢您的帮助如果
不匹配
大于阈值
,您可以将行的子集分配给NA
soustraction.i=function(D,R,i,threshold){
D=as.data.frame(D)
R=as.data.frame(R)
dif= purrr::map2_df(D, R[i,], `-`)
dif[dif<0] = 0
dif$mismatch=rowSums(dif)
dif$mismatch[dif$mismatch > threshold] <- NA
return(dif)
}
soutraction.i=函数(D,R,i,阈值){
D=as.data.frame(D)
R=as.data.frame(R)
dif=purrr::map2_-df(D,R[i,],`-`)
dif[dif threshold]您可以将行的子集分配给NA
,其中不匹配
大于阈值
soustraction.i=function(D,R,i,threshold){
D=as.data.frame(D)
R=as.data.frame(R)
dif= purrr::map2_df(D, R[i,], `-`)
dif[dif<0] = 0
dif$mismatch=rowSums(dif)
dif$mismatch[dif$mismatch > threshold] <- NA
return(dif)
}
soutraction.i=函数(D,R,i,阈值){
D=as.data.frame(D)
R=as.data.frame(R)
dif=purrr::map2_-df(D,R[i,],`-`)
dif[dif threshold]这里有一个dplyr
解决方案。它应该适用于threshold==0
时,并推广到其他阈值:
soustraction.i=function(D,R,i,threshold){
D=as.data.frame(D)
R=as.data.frame(R)
dif=map2_df(D, R[i,], `-`)
dif[dif<0] = 0
dif$mismatch=rowSums(dif)
dif <- dif %>%
mutate(mismatch = case_when(mismatch > threshold ~ NA_real_,
TRUE ~ mismatch))
return(dif)
}
下面是一个dplyr
解决方案。它应该适用于threshold==0
时,并推广到其他阈值:
soustraction.i=function(D,R,i,threshold){
D=as.data.frame(D)
R=as.data.frame(R)
dif=map2_df(D, R[i,], `-`)
dif[dif<0] = 0
dif$mismatch=rowSums(dif)
dif <- dif %>%
mutate(mismatch = case_when(mismatch > threshold ~ NA_real_,
TRUE ~ mismatch))
return(dif)
}
谢谢@latlio的回复!这就是我想要的。我很感激。谢谢@latlio的回复!这就是我想要的。我很感激。
soustraction.i(data_D[,3:7],data_R[,3:7],1,0)
# A tibble: 8 x 6
A B C D E mismatch
<dbl> <dbl> <dbl> <dbl> <dbl> <dbl>
1 0 0 0 0 0 0
2 0 0 0 0 0 0
3 0 0 0 0 0 0
4 0 0 0 0 0 0
5 0 0 0 0 0 0
6 0 0 0 0 0 0
7 1 1 0 0 1 NA
8 1 1 0 0 0 NA
soustraction.i <- function(D,R,i,threshold){
D <- as_tibble(D)
R <- as_tibble(R)
dif <- map2_df(D, R[i,], `-`) %>%
mutate(across(everything(), ~ifelse(.x < 0, 0, .x))) %>%
rowwise() %>%
mutate(mismatch = sum(c_across(everything())),
mismatch = case_when(as.numeric(mismatch) > threshold ~ NA_real_,
TRUE ~ mismatch))
return(dif)
}