R 按特定字符分隔文本列表
我下载了一个.bed文件,并使用此R 按特定字符分隔文本列表,r,database-partitioning,R,Database Partitioning,我下载了一个.bed文件,并使用此https://genome.ucsc.edu/cgi-bin/hgLiftOver 现在我想使用此代码在R中加载转换后的文件“datahg38.bed” library(rtracklayer) dataset<-import.bed("datahg38.bed") 有没有办法解决这个问题 所以我发现输出格式是一个300000乘1的列表,应该是一个300000包含3个变量的表 格式是这样的 chr1:10142-10351 c
https://genome.ucsc.edu/cgi-bin/hgLiftOver
现在我想使用此代码在R中加载转换后的文件“datahg38.bed”
library(rtracklayer)
dataset<-import.bed("datahg38.bed")
有没有办法解决这个问题
所以我发现输出格式是一个300000乘1的列表,应该是一个300000包含3个变量的表
格式是这样的
chr1:10142-10351
chr1:10453-10563
chr1:13044-13104
.
.
.
chr1 10142 10351
chr1 10453 10563
chr1 13044 13104
...
所以基本上我需要用read.table
把它作为一个表来读,然后把它转换成一个300000的3的矩阵。和字符:
,-
应用于分割数据。
我正在寻找这样的输出
chr1:10142-10351
chr1:10453-10563
chr1:13044-13104
.
.
.
chr1 10142 10351
chr1 10453 10563
chr1 13044 13104
...
那么,谁能建议一种有效的方法来分离这些数据呢