R：读取csv，查找第一行匹配模式

因此，我正在使用一些软件将数据输出为csv文件，格式如下：

# Parameter 1
ID,Col1,Col2,Col3
1,a,b,c
2,d,e,f
3,g,h,i
[...]
j,x,y,z

# Parameter 2
ID,Col1,Col2,Col3
1,a,b,c
2,d,e,f
3,g,h,i
[...]
k,x,y,z

# Parameter 3
ID,Col1,Col2,Col3
1,a,b,c
2,d,e,f
3,g,h,i
[...]
n,x,y,z

---

如果我需要读取参数1的第10行，我会使用

read.csv（'file.csv'，header=FALSE，skip=10，nrows=1）

，这会给我想要的。但是，如果我想读到参数2的第10个观察值，我不知道要分配哪个整数，因为参数1中的观察值数量可变。如果我能找出与字符串

“#参数2”

匹配的行号，我就可以解决这个问题。我该怎么做呢？

您可以使用

阅读行

# Assuming that what indicates the
#  start of param2 is the follwing line
param2.indic <- "# Parameter 2"


# read in the raw file
lines <- readLines("path\to\file.csv")

# find the start of parameter 2
p2.start <- grep(param2.indic, lines)

# go down n+2 lines from p2.start
n <- 10  # which line to find
lines[p2.start + n + 2]

#假设
#param2的开头是以下行
param2.indi您可以使用
readLines

# Assuming that what indicates the
#  start of param2 is the follwing line
param2.indic <- "# Parameter 2"


# read in the raw file
lines <- readLines("path\to\file.csv")

# find the start of parameter 2
p2.start <- grep(param2.indic, lines)

# go down n+2 lines from p2.start
n <- 10  # which line to find
lines[p2.start + n + 2]

#假设
#param2的开头是以下行
param2.indi您可以阅读这些行，直到找到匹配的行，然后从那里开始

示例：我一直在读行，直到找到匹配的行。在本例中，我的文件有一个需要跳过的长多行标题，后面是一个普通的电子表格样式的csv。我正在寻找标题行，我知道它以“Sample_ID”作为第一个元素开始

csvreader = csv.reader(csvfile, delimiter=',', quotechar='"')
for row in csvreader:
    if row[0].strip() == 'Sample_ID':
        header = row
        break

现在，我已经将该行排到了标题行，我可以按照自己的喜好处理文件的其余部分：

sample_ids = []
for row in csvreader:
    sample_ids.append(row[0])

你可以阅读这些行，直到找到匹配的那一行，然后从那里开始

示例：我一直在读行，直到找到匹配的行。在本例中，我的文件有一个需要跳过的长多行标题，后面是一个普通的电子表格样式的csv。我正在寻找标题行，我知道它以“Sample_ID”作为第一个元素开始

csvreader = csv.reader(csvfile, delimiter=',', quotechar='"')
for row in csvreader:
    if row[0].strip() == 'Sample_ID':
        header = row
        break

现在，我已经将该行排到了标题行，我可以按照自己的喜好处理文件的其余部分：

sample_ids = []
for row in csvreader:
    sample_ids.append(row[0])

您粘贴的是文件的文字内容吗？如果没有，那会有帮助的不，如果不清楚的话，很抱歉。但是使用这些简化的数据提问更容易，如果我知道如何找到与字符串匹配的行号，那么扩展就足够容易了。使用
grep
匹配字符串。粘贴的是文件的文字内容吗？如果没有，那会有帮助的不，如果不清楚的话，很抱歉。但是使用这个简化的数据提问更容易，如果我知道如何找到与字符串匹配的行号，那么扩展就足够容易了。使用
grep
匹配字符串。很好！有没有办法强迫grep只返回完美匹配？例如，如果我有另一行“#Parameter 2 Meta”，我不希望它也匹配？我尝试设置fixed=TRUE，但它似乎没有达到我的预期。是的，使用锚
grep（paste0（“^”，PATTERN，“$”，string）
-看看www.regular-expressions.info/reference.html这是一个很好的答案，让我想到了其他解决方案。hoever，如果您的示例代码是可执行的，那就太好了
param2.indi
和
p2.start
在编写时不是好的python变量。我会使用
parameter_2=“#parameter 2”
和
p2_start=grep（parameter_2，line）
。很好！有没有办法强迫grep只返回完美匹配？例如，如果我有另一行“#Parameter 2 Meta”，我不希望它也匹配？我尝试设置fixed=TRUE，但它似乎没有达到我的预期。是的，使用锚
grep（paste0（“^”，PATTERN，“$”，string）
-看看www.regular-expressions.info/reference.html这是一个很好的答案，让我想到了其他解决方案。hoever，如果您的示例代码是可执行的，那就太好了
param2.indi
和
p2.start
在编写时不是好的python变量。我将使用
parameter_2=“#parameter 2”
和
p2_start=grep（parameter_2，line）
。