ggiraph中geom_line_交互缺少工具提示
我想在ggiraph中geom_line_交互缺少工具提示,r,ggplot2,tooltip,survival-analysis,ggiraph,R,Ggplot2,Tooltip,Survival Analysis,Ggiraph,我想在ggsurvplot中添加工具提示。我正在使用ggiraph显示绘图。由于ggiraph没有geom_step_interactive,因此我正在处理ggsurvplot的数据输出,以获得step函数值,并使用geom_line_interactive在我的ggsurvplot上覆盖一条线并添加工具提示。以下是正常工作的代码: library(ggiraph) library(survminer) library(survival) #Function to get the step
ggsurvplot
中添加工具提示。我正在使用ggiraph
显示绘图。由于ggiraph
没有geom_step_interactive
,因此我正在处理ggsurvplot
的数据输出,以获得step函数值,并使用geom_line_interactive
在我的ggsurvplot上覆盖一条线并添加工具提示。以下是正常工作的代码:
library(ggiraph)
library(survminer)
library(survival)
#Function to get the step function points
step_func <- function(data, direction="hv", x , y) {
direction <- match.arg(direction, c("hv", "vh"))
data <- as.data.frame(data)[order(data[, x]), ]
n <- nrow(data)
if (n <= 1) {
# Need at least one observation
return(data[0, , drop = FALSE])
}
if (direction == "vh") {
xs <- rep(1:n, each = 2)[-2*n]
ys <- c(1, rep(2:n, each = 2))
} else {
ys <- rep(1:n, each = 2)[-2*n]
xs <- c(1, rep(2:n, each = 2))
}
return(data.frame(
x = data[,x][xs],
y = data[,y][ys],
data[xs, setdiff(names(data), c(x, y))]
))
}
fit<- survfit(Surv(time, status) ~ sex, data = lung )
g <- ggsurvplot(fit, data = lung, risk.table = TRUE,
risk.table.pos= "out", risk.table.y.text = TRUE)
dat1 <- plyr::ddply(g$plot$data, "strata", step_func, "hv", "time", "surv")
dat1$tooltip <- paste0("Time:", dat1$x)
gg<- g$plot+geom_line_interactive(data = dat1, aes(x= x, y=y, colour = strata, tooltip= tooltip ), size = .75)
ggiraph(code = print(gg))
库(ggiraph)
图书馆(survminer)
图书馆(生存)
#函数获取阶跃函数点
step_func工具提示太长时,geom_line\u interactive
工具提示消失。您可以截断结果中的值以保持其简短。以下工作:
dat1$tooltip <- paste0("Time:", dat1$x, " Surv:", round(dat1$y,2) )
dat1$工具提示谢谢。这太完美了!当您选择“geom\u line\u interactive”时,工具提示似乎存在某种问题geom\u point\u interactive
似乎是完美的解决方案!谢谢顺便说一句,如果你能投赞成票,我将不胜感激(争取我的徽章和答题积分不算在内)