'；A局部-1.14'；在docker容器中安装R程序包时丢失

在使用最新的bioconductor image release_core2构建docker容器时，我正在尝试安装flowDensity软件包。我收到以下错误：

错误：依赖项“rgeos”、“flowWorkspace”不可用于 包装“流动密度”

我可以通过向dockerfile添加

apt get install libgeos dev

来修复第一个问题。然而，第二个更棘手。它归结为包RProtoBufLib，它是cytolib的依赖项，因此也是flowWorkspace的依赖项。我在安装RProtoBufLib时收到以下错误：

config.status:错误：找不到输入文件：`config.h.in'
CDPATH=“${ZSH_VERSION+.}:&&cd.&&/bin/bash/tmp/Rtmpro4BMN/R.INSTALL65e11754ab1d/RProtoBufLib/src/protobuf-2.6.0/missing aclocal-1.14-I m4
/tmp/Rtmpro4BMN/R.INSTALL65e11754ab1d/RProtoBufLib/src/protobuf-2.6.0/缺失：第81行：未找到aclocal-1.14:命令
警告：您的系统上缺少“aclocal-1.14”。
只有在修改“acinclude.m4”或
“configure.ac”或“configure.ac”包含的m4文件。
“aclocal”计划是GNU Automake软件包的一部分：
它还需要GNU Autoconf、GNU m4和Perl才能运行：
make:**[aclocal.m4]错误127
Makefile:407:目标“aclocal.m4”的配方失败

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我找到了，但我不知道在构建docker容器时如何进行。欢迎提出任何建议。谢谢

我已在本地环境中重新创建了您的问题。问题是您没有安装automake、autoconf和libtoolize

这是我的

install.R

和

Dockerfile

脚本

安装.R:

install.packages( c('RProtoBufLib', 'flowDensity'), dependencies = TRUE, repos = c('http://bioconductor.org/packages/3.6/bioc', 'https://cloud.r-project.org') )

Dockerfile：

FROM bioconductor/release_core2

RUN apt-get update \
    && apt-get install -y --no-install-recommends \
          libgeos-dev ed \
          automake autoconf libtool \
    && rm -rf /var/lib/apt/lists/*

ADD install.R /tmp

RUN Rscript /tmp/install.R \
    && rm -rf /tmp/downloaded_packages/ /tmp/*.rds \
    && rm -rf /var/lib/apt/lists/* \
    && rm -rf /usr/share/info/* \
    && rm -rf /usr/share/man/* \
    && rm -rf /usr/share/doc/* \
    && rm -rf /var/lib/dpkg/info

为了构建项目，我执行了以下命令：

docker build -t rbiotest .

注意：构建时间似乎是永恒的

docker build -t rbiotest .