如何在公式表达式(R)中计算函数
假设我想写一个可以像普通lm型函数一样使用的函数:y~x 此外,我希望函数返回输入变量的完整model.matrix,这些变量可能具有平滑项作为解释变量,即,输入向量的一列首先由B样条函数求值,然后返回 我的小函数如下所示:如何在公式表达式(R)中计算函数,r,function,formula,spline,gam,R,Function,Formula,Spline,Gam,假设我想写一个可以像普通lm型函数一样使用的函数:y~x 此外,我希望函数返回输入变量的完整model.matrix,这些变量可能具有平滑项作为解释变量,即,输入向量的一列首先由B样条函数求值,然后返回 我的小函数如下所示: model <- function(formula, data=list()){ mf <- model.frame(formula=formula, data=data) return(mf) } 其中,样条曲线(x2,5,1)是x2的平滑影响。我的样条函数
model <- function(formula, data=list()){
mf <- model.frame(formula=formula, data=data)
return(mf)
}
其中,样条曲线(x2,5,1)
是x2
的平滑影响。我的样条函数定义如下:
spline <- function(var,n,d){
name <- deparse(substitute(var))
Basis <- data.table(i=1:(n+d))
Basis <- Basis[,B(i,d,var,knots(n,d,min(var),max(var))), by="i"]
Basis[,numbers:=rep(1:length(var))]
Basis <- as.data.table(dcast(Basis, numbers ~ i, value.var="V1"))
Basis[,numbers:=NULL]
setnames(Basis,names(Basis),paste0(name,".",1:(n+d)))
return(Basis)
}
B <- function(i,d,t,knots){
a <- (t - knots[i]) / ( knots[i+d] - knots[i] )
a <- ifelse(is.nan(a),0,a)
a <- ifelse(is.infinite(a),0,a)
b <- (knots[i+d+1] - t) / ( knots[i+d+1] - knots[i+1] )
b <- ifelse(is.nan(b),0,b)
b <- ifelse(is.infinite(b),0,b)
if(d==0)
return( ifelse(t>=knots[i] & t < knots[i+1],1,0) )
else
return( a*B(i,d-1,t,knots)+b*B(i+1,d-1,t,knots) )
}
knots <- function(m,d,min,max){
k <- seq(min,max,length.out=m+1)
step <- k[2]-k[1]
outer.l <- rev(min(k)-step*(1:d))
outer.r <- max(k)+step*(1:d)
return(c(outer.l,k,outer.r))
}
spline我没有激活“自我回答”选项,但是如果有人遇到这样的问题,这里的解决方案是:通过样条函数返回的对象不是矩阵。如果它被转换成这样,一切都会按照预期的方式工作。
spline <- function(var,n,d){
name <- deparse(substitute(var))
Basis <- data.table(i=1:(n+d))
Basis <- Basis[,B(i,d,var,knots(n,d,min(var),max(var))), by="i"]
Basis[,numbers:=rep(1:length(var))]
Basis <- as.data.table(dcast(Basis, numbers ~ i, value.var="V1"))
Basis[,numbers:=NULL]
setnames(Basis,names(Basis),paste0(name,".",1:(n+d)))
return(Basis)
}
B <- function(i,d,t,knots){
a <- (t - knots[i]) / ( knots[i+d] - knots[i] )
a <- ifelse(is.nan(a),0,a)
a <- ifelse(is.infinite(a),0,a)
b <- (knots[i+d+1] - t) / ( knots[i+d+1] - knots[i+1] )
b <- ifelse(is.nan(b),0,b)
b <- ifelse(is.infinite(b),0,b)
if(d==0)
return( ifelse(t>=knots[i] & t < knots[i+1],1,0) )
else
return( a*B(i,d-1,t,knots)+b*B(i+1,d-1,t,knots) )
}
knots <- function(m,d,min,max){
k <- seq(min,max,length.out=m+1)
step <- k[2]-k[1]
outer.l <- rev(min(k)-step*(1:d))
outer.r <- max(k)+step*(1:d)
return(c(outer.l,k,outer.r))
}