如何使用littler提供的install2.r从bioconductor安装？

我正在尝试使用安装一些软件包，在此期间，我得到的错误依赖关系“图形”不可用。这个软件包似乎可以从Bioconductor项目获得，但我不知道如何使用install2.r安装它

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那么，具体来说，我如何使用install2.r安装bioconductor软件包？

您不能，因为bioconductor使用不同的存储库结构

但由于这是一个非常常见的问题，我最近添加了一个帮助脚本installBioc.r，供您使用。要使用它，首先要做

 install.r littler BiocManager

确保我们拥有当前littler版本以及我们需要的BioC包BioManager。然后使用eg

  /usr/local/lib/R/site-library/littler/examples/installBioc.r S4Vectors

它将启动并安装BiocVersion、S4Vectors以及

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依赖生物泛型。

谢谢德克！还有一个问题：因为我知道其中一个包依赖于Bioconductor的graph，所以我应该在运行install2.r之前运行installBioc.r graph？与此相关的是，install2.r是否可以建议从Bioconductor下载丢失的软件包作为错误/警告的一部分？顺便说一句，我真的很喜欢使用install2.r和rocker进行与地理空间相关的r工作！我非常感谢你为R社区所做的一切。一、 就我个人而言，非常感谢！谢谢你的客气话和好问题。我有点模糊，但现在也有一些容器需要生物包装，因此新的助手。我倾向于从克兰那里得到我需要的东西，但我认为当我们向生物经理喊话时，它也会从克兰那里带来我们需要的任何东西。系统库的老问题当然没有解决，因为CRAN+BioC安装程序没有与apt交互，但我想你知道……处理系统库是一个难题……尤其是让地理空间包在R中可靠工作……所以我完全理解。非常感谢。