尝试在R中聚合反应类型

结果样本

Activity      ReactionType      numberActivities

activator     activates         16
binding       binds             83
recombinase   binds             1
branching     branches          3
carboxylase   carboxylates      36
peptidase     cleaves           425
endopeptidase cleaves           368
nuclease      cleaves           53
glycosylase   cleaves           24
cyclase       converts          12
transhydrogenase converts       3
hist deacetylase deacetylates   8
deacetylase   deacetylates      16

我想数一数所有相同的反应类型，并总结它们的数量

reaction_types <-aggregate(numberActivities ~ ReactionType, unique(outAct), FUN=sum)

问题是，我得到了重复项，也就是说，它们没有被计算为一个唯一的反应类型，例如，输出包含以下行：

deacetylates    8
deacetylates    16

在整个输出文件中有更多类似的示例。 我哪里做错了

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提前感谢。

您的字符串中是否有空格？作为.character（唯一（outAct$ReactionType））的输出是什么？Alistaire，我如何检查空格？Jean，我不理解您的评论。你是说在上面的聚合函数中？输出来自作用于outActAdiana的此函数，库dplyr在我的环境中似乎不起作用，并且它无法识别语句out%%>%group_by（ReactionType）%%>%summary（number=sum（numberActivities））eval（expr，envir，enclose）中的错误（expr，envir，enclose）：对象“out”未找到如何从我的outAct$ReactionType列中去掉空白？粘贴（反应类型）[1]“c（\'phosphorylates\”、\'cleaves\”、\'transfers\、\'transports\”、\'hydrophyses\”、\'dephosphorylates\、\'reduces\，\”脱氢酶\“，”连接物\“，”交换（核苷酸）\“，”钳位加载器绑定\“，”交换（核苷酸）\“，”绑定\“，”等等，这就是问题所在，一些有空格和反斜杠，另一些只是反斜杠。我如何清理？

library(dplyr)
outAct %>% group_by(ReactionType) %>% summarise(number = sum(numberActivities)) 

library(dplyr)
outAct %>% group_by(ReactionType) %>% summarise(number = sum(numberActivities))