R 循环以筛选一列中0的值

我正在尝试从AFR_META列中删除0的所有值

head(data1)
  CHR    BP REF ALT  AFR_META     LOG SNPid
1   1 11063   T   G 0.0002751 8.19838     1
2   1 13259   G   A 0.0002778 8.18861     2
3   1 17641   G   A 0.0008361 7.08676     3

我以前在一个单独的数据集上使用过以下内容，效果非常好：

data1<-data1[-which(data1$AFR_META==0),]

---

任何指导和帮助都很好！我现在正在R中工作，但可以在帮助下使用awk在linux中运行它。我之前试过awk，但没能写出正确的过滤器。对不起，这是新来的，我一直在绕着这个转。终于求助了！非常感谢大家。

也许您已经可以用Ronak Shah的评论解决您的问题，将浮点值与零进行比较确实不是一个好主意

但是，如果您打算删除AFR_META正好为零的所有行，那么当没有这样的行时就会出现问题。

的结果（data1$AFR\u META==0）

是一个

整数（0）

，它将删除数据帧的所有行

不使用索引，只需使用逻辑向量选择要删除的行：

---

data1浮点比较不准确。您可以尝试
data10，]
data1<-data1[-which(data1$AFR_META==0),]
head(data1)
[1] CHR      BP       REF      ALT      AFR_META LOG      SNPid   
<0 rows> (or 0-length row.names)

sapply(data1, class)
      CHR        BP       REF       ALT  AFR_META       LOG     SNPid 
"numeric" "integer"  "factor"  "factor" "numeric" "numeric" "integer"

library(dplyr)

# filtering all zero values
filter(data1, AFR_META != 0)

# or, adressing the floating point issue
filter(data1, !between(AFR_META, -0.0001, 0.0001))