R的Bash包装器

我想通过从Bash中为某个R函数提供一些参数来调用它，并存储该函数返回的值。差不多

#!/usr/bin/Rscript

myfunction(arg1, arg2){
...
...
return(ValueToReturn)
}

从Bash中调用它

$ returnedvalue = on ./myscript.r call myfunction -arg1 -arg2

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到目前为止，我能想到的唯一解决方案是在文件中写入参数，然后调用R脚本'/myscrpt.R'，其中'myfunction'从文件中读取参数，然后在我可以从Bash读取的文件上写入“ValueToReturn”。

据我所知，这是不可能的，因为父shell和子shell是相关的：子shell不允许更改父shell的环境，这就是为什么放置：

system(paste0("export returnedvalue=", ValuetoReturn))

将仅将该变量导出到当前环境以及环境生成的任何后续子shell

一种丑陋的方法可能是将输出保存到具有以下内容的文件：

system(paste0("echo 'export returnedvalue=", ValuetoReturn, "' > setvars.txt"))

然后，在父shell源文件中：

. ./setvars.txt

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至少通过这种方式，您可以保存多个输出。

不直接回答，但此帮助页面可能会引起兴趣：我不完全清楚您在寻找什么，但我觉得该软件包可能对您有用；我现在无法测试这一点，因为我必须重新启动到我的Linux分区。将结果存储到一个文件中，然后添加几个bash命令将文件内容加载到一个变量中并不是那么糟糕。