对于R3.0.1中频繁的、不可生产的segfault错误,我能做些什么?
在升级到R3.0.X之后,我开始出现非常频繁的、不可重现的segfault错误,就像我在R2.X.X中从未遇到过的错误一样。例如,这是刚刚导致故障的长代码块的会话信息。然而,在R崩溃后,我再次运行了整个代码块,没有出现错误对于R3.0.1中频繁的、不可生产的segfault错误,我能做些什么?,r,segmentation-fault,R,Segmentation Fault,在升级到R3.0.X之后,我开始出现非常频繁的、不可重现的segfault错误,就像我在R2.X.X中从未遇到过的错误一样。例如,这是刚刚导致故障的长代码块的会话信息。然而,在R崩溃后,我再次运行了整个代码块,没有出现错误 R version 3.0.1 (2013-05-16) Platform: x86_64-apple-darwin10.8.0 (64-bit) locale: [1] en_US.UTF-8/en_US.UTF-8/en_US.UTF-8/C/en_US.UTF-8/e
R version 3.0.1 (2013-05-16)
Platform: x86_64-apple-darwin10.8.0 (64-bit)
locale:
[1] en_US.UTF-8/en_US.UTF-8/en_US.UTF-8/C/en_US.UTF-8/en_US.UTF-8
attached base packages:
[1] stats graphics grDevices utils datasets methods base
other attached packages:
[1] klaR_0.6-8 ggplot2_0.9.3.1 labdsv_1.5-0 MASS_7.3-26 mgcv_1.7-22
[6] cluster_1.14.4 sparcl_1.0.3 FD_1.0-11 vegan_2.0-7 permute_0.7-0
[11] geometry_0.3-3 magic_1.5-4 abind_1.4-0 ape_3.0-8 ade4_1.5-2
[16] plyr_1.8
loaded via a namespace (and not attached):
[1] class_7.3-7 colorspace_1.2-2 dichromat_2.0-0 digest_0.6.3
[5] e1071_1.6-1 grid_3.0.1 gtable_0.1.2 labeling_0.1
[9] lattice_0.20-15 Matrix_1.0-12 munsell_0.4 nlme_3.1-109
[13] proto_0.3-10 RColorBrewer_1.0-5 reshape2_1.2.2 scales_0.2.3
[17] stringr_0.6.2
有时,内核完全冻结,我不得不强制退出,但其他时候,它允许我退出内核转储或保存工作区的选项
另一篇帖子中有人建议设置选项(CBoundsCheck=T)
,这似乎有效了一段时间,但我仍然经常遇到故障
我不认为这些错误与任何特定类型的计算或函数有关,因为前几天我在开始一个新会话并只设置工作目录和选项后得到了一个错误。触发故障的代码和系统信息如下所示:
#Set my working directory
setwd("~/Documents/School Spring 2013/Quaternary Dissasembly/Functional Diversity Basefile 3")
#Keep getting segfaults all the time. This might fix it
options(CBoundsCheck=T)
sessionInfo()
R version 3.0.1 (2013-05-16)
Platform: x86_64-apple-darwin10.8.0 (64-bit)
locale:
[1] en_US.UTF-8/en_US.UTF-8/en_US.UTF-8/C/en_US.UTF-8/en_US.UTF-8
attached base packages:
[1] stats graphics grDevices utils datasets methods base
任何人都可以给我任何帮助,以找到并修复错误或错误的设置,我将不胜感激。多谢各位
-M按照的调试部分的和部分中的说明进行操作。我也遇到了同样的问题。3.0.2立即修复。