R:与字符串向量不匹配的矩阵子集行
我有一个基因表达数据矩阵,其中行是不同的基因,列是样本 我有一个基因载体,我想从矩阵中筛选出来。使用基本语法,仅使用这些基因创建矩阵很容易:R:与字符串向量不匹配的矩阵子集行,r,R,我有一个基因表达数据矩阵,其中行是不同的基因,列是样本 我有一个基因载体,我想从矩阵中筛选出来。使用基本语法,仅使用这些基因创建矩阵很容易: expression_matrix[excluded_genes,] 但我不知道如何做相反的事情,也就是从矩阵中移除那些基因,而不是选择它们。我四处搜索,但没有找到(或理解)解决这个问题的方法。希望这能有所帮助 # Create data X <- iris[1:4, ] X # Sepal.Length Sepal.Width Petal.L
expression_matrix[excluded_genes,]
但我不知道如何做相反的事情,也就是从矩阵中移除那些基因,而不是选择它们。我四处搜索,但没有找到(或理解)解决这个问题的方法。希望这能有所帮助
# Create data
X <- iris[1:4, ]
X
# Sepal.Length Sepal.Width Petal.Length Petal.Width Species
#1 5.1 3.5 1.4 0.2 setosa
#2 4.9 3.0 1.4 0.2 setosa
#3 4.7 3.2 1.3 0.2 setosa
#4 4.6 3.1 1.5 0.2 setosa
# Remove the rows one and two
rows_to_remove <- c("1", "2")
X[!rownames(X) %in% rows_to_remove, ]
# Sepal.Length Sepal.Width Petal.Length Petal.Width Species
#3 4.7 3.2 1.3 0.2 setosa
#4 4.6 3.1 1.5 0.2 setosa
#创建数据
X