如何使用flowCore模拟R中flowjo的直方图图?

如何使用flowCore模拟R中flowjo的直方图图?,r,bioconductor,R,Bioconductor,我是flowCore+R的新手。我想在选通后模拟一个直方图,可以在FlowJo软件中手动完成。我得到了一些类似的东西,但它看起来不太正确,因为它是一个“密度”图,并且被移动了。如何使x轴移动并看起来与FlowJo输出绘图的方式相似?我试着阅读这份文件,但找不到与FlowJo中类似的情节:感谢您的指导。谢谢 代码段: 库(flowCore) parentpath之所以“移位”,是因为在flowJo图中x轴是对数轴(以10为底)。要在R中获得相同的结果,请添加 + scale_x_log10()

我是flowCore+R的新手。我想在选通后模拟一个直方图,可以在FlowJo软件中手动完成。我得到了一些类似的东西,但它看起来不太正确,因为它是一个“密度”图,并且被移动了。如何使x轴移动并看起来与FlowJo输出绘图的方式相似?我试着阅读这份文件,但找不到与FlowJo中类似的情节:感谢您的指导。谢谢

代码段:
库(flowCore)
parentpath之所以“移位”,是因为在flowJo图中x轴是对数轴(以10为底)。要在R中获得相同的结果,请添加

+ scale_x_log10()
在现有代码之后。这可能会与您设置的轴限制发生奇怪的交互,在您的脑海中是如此赤裸裸

要使y轴“计数”而不是“密度”,可以将ggcyto()调用的第一行更改为:

让我知道这是否有效-我手头没有你的数据,所以这些都是记忆

对于任何纯粹的美学变化,它们都相对容易实现。

之所以“移位”,是因为在flowJo图中x轴是对数的(以10为底)。要在R中获得相同的结果,请添加

+ scale_x_log10()
在现有代码之后。这可能会与您设置的轴限制发生奇怪的交互,在您的脑海中是如此赤裸裸

要使y轴“计数”而不是“密度”,可以将ggcyto()调用的第一行更改为:

让我知道这是否有效-我手头没有你的数据,所以这些都是记忆


对于任何纯粹的美学变化,它们都相对容易实现。

谢谢!我使用了双指数变换,它成功了!谢谢我使用了双指数变换,它成功了!
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