R 用指数估计值填空
我试图用指数增长的数字来填充NA值。下面是我试图做的一个数据示例R 用指数估计值填空,r,exponential,imputets,R,Exponential,Imputets,我试图用指数增长的数字来填充NA值。下面是我试图做的一个数据示例 library(tidyverse) expand.grid(X2009H1N1 = "0-17 years", type = "Cases", month = seq(as.Date("2009-04-12") , to = as.Date("2010-03-12"), by = "month")) %>% bind_cols( data.frame( Mi
library(tidyverse)
expand.grid(X2009H1N1 = "0-17 years",
type = "Cases",
month = seq(as.Date("2009-04-12") , to = as.Date("2010-03-12"), by = "month")) %>%
bind_cols( data.frame(
MidLevelRange = c(0,NA,NA,NA,NA,NA,8000000,16000000,18000000,19000000,19000000,19000000),
lowEst = c(0,NA,NA,NA,NA,NA,5000000,12000000,12000000,13000000,14000000,14000000)
))
我使用了%%>%arrange(月,X2009H1N1)%%>%
分组依据(X2009H1N1,类型)%>%
变异(近似值MidLevelRange=zoo::na.approx(MidLevelRange,na.rm=FALSE))
但结果在我看来不是指数型的。谢谢确保您的结果不是指数型的,您正在使用函数na.approx()
使用线性插值来插补值。您正在使用的zoo
软件包提供了使用na.spline()
函数使用三次样条插值进行插值,但该函数也不会生成指数曲线
x%
绑定列(数据帧(中间级别范围=c(0,不适用,不适用,不适用,不适用,不适用,不适用,80000016000018000001900001000000),
最低=c(0,不适用,不适用,不适用,不适用,不适用
x%>%安排(月,X2009H1N1)%>%
分组依据(X2009H1N1,类型)%>%
变异(近似于中间水平范围=动物园::na.样条曲线(中间水平范围))
三次样条插值的问题是,最小值将被插值为负值,这取决于这是否是您正在寻找的行为:
#一个tible:8 x 6
#分组:X2009H1N1,类型[1]
X2009H1N1型月中档最低约X_中档
10-17岁个案2009-04-12
2 0-17岁病例2009-05-12 NA-18568160。
3 0-17岁病例2009-06-12 NA-25223342。
4 0-17岁病例2009-07-12 NA-22929832。
5 0-17岁病例2009-08-12 NA-14651914。
6 0-17岁病例2009-09-12 NA-3353875。
7 0-17年案例2009-10-12 8000000 5000000。
查看输入数据包。
它为时间序列提供了大量的插补函数。请看一下这篇文章,以便对所有提供的选项有一个很好的概述
在您的案例中,使用斯汀曼插值(inputets::na_插值(x,option=“stine”
)可能是一个合适的选项
以下是您提供的示例:
x <- expand.grid(
X2009H1N1 = "0-17 years",
type = "Cases",
month = seq(as.Date("2009-04-12"),
to = as.Date("2010-03-12"),
by = "month"
)
) %>%
bind_cols(data.frame(
MidLevelRange = c(0, NA, NA, NA, NA, NA, 8000000, 16000000, 18000000, 19000000, 19000000, 19000000),
lowEst = c(0, NA, NA, NA, NA, NA, 5000000, 12000000, 12000000, 13000000, 14000000, 14000000)
))
x %>%
arrange(month, X2009H1N1) %>%
group_by(X2009H1N1, type) %>%
mutate(aprox_MidLevelRange = imputeTS::na_interpolation(MidLevelRange, option = "stine"))
imputeTS中的线性/样条线选项与zoo::approx()/zoo::spline()相同。zoo中不存在stine
# A tibble: 12 x 6
# Groups: X2009H1N1, type [1]
X2009H1N1 type month MidLevelRange lowEst aprox_MidLevelRange
<fct> <fct> <date> <dbl> <dbl> <dbl>
1 0-17 years Cases 2009-04-12 0 0 0
2 0-17 years Cases 2009-05-12 NA NA 593718.
3 0-17 years Cases 2009-06-12 NA NA 1335612.
4 0-17 years Cases 2009-07-12 NA NA 2289061.
5 0-17 years Cases 2009-08-12 NA NA 3559604.
6 0-17 years Cases 2009-09-12 NA NA 5336975.
7 0-17 years Cases 2009-10-12 8000000 5000000 8000000
8 0-17 years Cases 2009-11-12 16000000 12000000 16000000
9 0-17 years Cases 2009-12-12 18000000 12000000 18000000
10 0-17 years Cases 2010-01-12 19000000 13000000 19000000
11 0-17 years Cases 2010-02-12 19000000 14000000 19000000
12 0-17 years Cases 2010-03-12 19000000 14000000 19000000
imputeTS::na_interpolation(x, option ="linear")
imputeTS::na_interpolation(x, option ="spline")
imputeTS::na_interpolation(x, option ="stine")