当我制作没有错误信息的个人R包时，如何将函数与data.table结合起来？

我基于data.table R包制作了一个函数来处理带有重复项的矩阵

我已经在R studio中运行了我的代码，发现它工作正常。 所以我用roxygen2和devtools R包制作了我的R包

不幸的是，如果我附加我的库并运行函数，它会显示以下错误消息

.subset（x，j）中出错：下标类型“list”无效

我该如何解决这个问题

作用 例子

---

如果您试图创建一个包，请确保包含来自具有命名空间的其他包的所有函数。例如，直到我将

as.data.table（mm.dup）

更改为

data.table:：as.data.table（mm.dup）

，此代码才为我运行。之后，这对我来说毫无问题，谢谢你的评论，朱利安。您是否制作了包并附加它以运行代码？即使我添加了data.table:：as.data.table（mm.dup），当我通过package.No加载函数时，它仍然会显示错误消息。我不想做一个全新的包裹。代码是否在包外为您运行？您是否知道存在重复的

。矩阵

？请参见

？duplicated.matrix

另请参见在您自己的项目中使用

data.table

的vignette。如果您试图创建一个包，请确保包含来自具有命名空间的其他包的所有函数。例如，直到我将

as.data.table（mm.dup）

更改为

data.table:：as.data.table（mm.dup）

，此代码才为我运行。之后，这对我来说毫无问题，谢谢你的评论，朱利安。您是否制作了包并附加它以运行代码？即使我添加了data.table:：as.data.table（mm.dup），当我通过package.No加载函数时，它仍然会显示错误消息。我不想做一个全新的包裹。代码是否在包外为您运行？您是否知道存在重复的

。矩阵

？请参见

？复制的.matrix

另请参见在您自己的项目中使用

数据.table

的小插曲（以及一般创建下游项目）

dup.matrix=function(mm=NA,key_column=NA,my.Function=NA){

  # Check duplicates in key_column

    print('Check duplciates')
    dups=mm[,key_column]
    dups=unique(dups[which(duplicated(dups))])

  # Get duplicated matrix

    print('Check duplciate matrix')
    wh=which(mm[,key_column] %in% dups)
    mm.dup=mm[wh,]
    mm.uniq=as.data.frame(mm[-wh,],stringsAsFactors=F)


  # Apply function to duplicated matrix
    print('Apply function to duplicated matrix')
    mm.dup=as.data.table(mm.dup)
    mm.dup2=mm.dup[,lapply(.SD,my.Function),by=key_column]
    mm.dup2=as.data.frame(mm.dup2,stringsAsFactors=F)
  # combine unique and processed dup matrix
    print('Combine unique and processed dup matrix')
    mm2=rbind(mm.uniq,mm.dup2)
  # Export the results
    gc()
    return(mm2)
}

#-----------------------------------------
# Create matrix with duplicates
mat=matrix(rnorm(1000),nrow=100);mat[,1]=paste0('gene',sample(LETTERS,100,replace=T))
colnames(mat)=c('gene',paste0('sample',1:9))
mm=mat;key_column='gene';.function=max

# Run the function
mm2=dup.matrix(mm,key_column,my.Function=.function)
#-----------------------------------------