无法在r-docker中安装devtools_R_Docker_Shiny

无法在r-docker中安装devtools

r docker shiny

无法在r-docker中安装devtools,r,docker,shiny,R,Docker,Shiny,我正在尝试为我闪亮的应用程序构建一个docker图像。下面是我的dockerfile。当我构建映像时，其他一切似乎都正常，除了我在库（devtools）中收到错误消息error：没有名为“devtools”的包被暂停执行。我还尝试了devtools:：install_github（'nik01010/dashboardthemes'），但没有成功。我不知道为什么？会出什么问题？有人知道我的dockerfile有什么问题吗？非常感谢 # Install R version 3.6 FROM r-b

我正在尝试为我闪亮的应用程序构建一个docker图像。下面是我的

dockerfile

。当我构建映像时，其他一切似乎都正常，除了我在库（devtools）中收到错误消息

error：没有名为“devtools”的包被暂停执行

。我还尝试了

devtools:：install_github（'nik01010/dashboardthemes'）

，但没有成功。我不知道为什么？会出什么问题？有人知道我的dockerfile有什么问题吗？非常感谢

# Install R version 3.6
FROM r-base:3.6.0

# Install Ubuntu packages
RUN apt-get update && apt-get install -y \
    sudo \
    gdebi-core \
    pandoc \
    pandoc-citeproc \
    libcurl4-gnutls-dev \
    libcairo2-dev/unstable \
    libxt-dev \
    libssl-dev

# Download and install ShinyServer (latest version)
RUN wget --no-verbose https://s3.amazonaws.com/rstudio-shiny-server-os-build/ubuntu-12.04/x86_64/VERSION -O "version.txt" && \
    VERSION=$(cat version.txt)  && \
    wget --no-verbose "https://s3.amazonaws.com/rstudio-shiny-server-os-build/ubuntu-12.04/x86_64/shiny-server-$VERSION-amd64.deb" -O ss-latest.deb && \
    gdebi -n ss-latest.deb && \
    rm -f version.txt ss-latest.deb

# Install R packages that are required
RUN R -e "install.packages(c('devtools', 'shiny','shinythemes','shinydashboard','shinyWidgets','shinyjs', 'tidyverse', 'dplyr', 'ggplot2','rlang','DT','lubridate', 'plotly',  'leaflet', 'mapview', 'tigris', 'rgdal', 'visNetwork', 'wordcloud2', 'arules'), repos='http://cran.rstudio.com/')"
RUN R -e "library(devtools)"
RUN R -e "install_github('nik01010/dashboardthemes')"


# Copy configuration files into the Docker image
COPY shiny-server.conf  /etc/shiny-server/shiny-server.conf
COPY /app /srv/shiny-server/

# Make the ShinyApp available at port 80
EXPOSE 80

# Copy further configuration files into the Docker image
COPY shiny-server.sh /usr/bin/shiny-server.sh

CMD ["/usr/bin/shiny-server.sh"]

您可以尝试几种方法

最简单：

使用

remotes:：安装\u github

而不是

devtools

<如果不需要其他功能，则代码>遥控器的依赖项要少得多

第二简单：

使用Docker Hub中的图像，而不是baseR图像

docker pull rocker/tidyverse

更改第2行：

FROM rocker/verse

最难：

否则，在安装

devtools

之前，您需要确定需要在docker映像中安装哪些依赖项。如果您尝试以交互方式安装它，这可能是显而易见的

确保容器正在运行

使用

docker ps

使用

docker exec-it/bin/bash启动shell

启动

并尝试以交互方式安装

devtools