由于缺少值,ggplot2(R)中拆分小提琴图中的标签出错
我正在使用此处创建的由于缺少值,ggplot2(R)中拆分小提琴图中的标签出错,r,ggplot2,label,tidyverse,violin-plot,R,Ggplot2,Label,Tidyverse,Violin Plot,我正在使用此处创建的geom_split_violen函数生成分割小提琴图: 然后,我为每个拆分的小提琴添加样本大小标签(n=…)。但是,存在一些缺失值,这会导致从缺失数据开始的错误标签 使用下面的代码,结果如下: 在底部网格(B)中,p2下没有填充值value=1。这会导致此后分裂小提琴的标签错误。具体而言,标签n=3和n=108被交换 有没有办法解决这个问题 以下是完整的代码: # Create data set.seed(12345) my_data = data.frame(
geom_split_violen
函数生成分割小提琴图:
然后,我为每个拆分的小提琴添加样本大小标签(n=…)。但是,存在一些缺失值,这会导致从缺失数据开始的错误标签
使用下面的代码,结果如下:
在底部网格(B)中,p2下没有填充值value=1
。这会导致此后分裂小提琴的标签错误。具体而言,标签n=3
和n=108
被交换
有没有办法解决这个问题
以下是完整的代码:
# Create data
set.seed(12345)
my_data = data.frame(
y=c(rnorm(1000, 15)),
type=c(rep("A", 635), rep("B", 365)),
variable=c(rep("p1", 151), rep("p2", 287), rep("p3", 197),
rep("p1", 73), rep("p2", 181), rep("p3", 111)),
value=c(rep("0", 89), rep("1", 62),
rep("0", 151), rep("1", 136),
rep("0", 101), rep("1", 96),
rep("0", 39), rep("1", 34),
rep("0", 181),
rep("0", 108), rep("1", 3)))
# Code to create geom_split_violin function from link above
library('ggplot2')
GeomSplitViolin <- ggproto("GeomSplitViolin", GeomViolin,
draw_group = function(self, data, ..., draw_quantiles = NULL) {
data <- transform(data, xminv = x - violinwidth * (x - xmin), xmaxv = x + violinwidth * (xmax - x))
grp <- data[1, "group"]
newdata <- plyr::arrange(transform(data, x = if (grp %% 2 == 1) xminv else xmaxv), if (grp %% 2 == 1) y else -y)
newdata <- rbind(newdata[1, ], newdata, newdata[nrow(newdata), ], newdata[1, ])
newdata[c(1, nrow(newdata) - 1, nrow(newdata)), "x"] <- round(newdata[1, "x"])
if (length(draw_quantiles) > 0 & !scales::zero_range(range(data$y))) {
stopifnot(all(draw_quantiles >= 0), all(draw_quantiles <=
1))
quantiles <- ggplot2:::create_quantile_segment_frame(data, draw_quantiles)
aesthetics <- data[rep(1, nrow(quantiles)), setdiff(names(data), c("x", "y")), drop = FALSE]
aesthetics$alpha <- rep(1, nrow(quantiles))
both <- cbind(quantiles, aesthetics)
quantile_grob <- GeomPath$draw_panel(both, ...)
ggplot2:::ggname("geom_split_violin", grid::grobTree(GeomPolygon$draw_panel(newdata, ...), quantile_grob))
}
else {
ggplot2:::ggname("geom_split_violin", GeomPolygon$draw_panel(newdata, ...))
}
})
geom_split_violin <- function(mapping = NULL, data = NULL, stat = "ydensity", position = "identity", ...,
draw_quantiles = NULL, trim = TRUE, scale = "area", na.rm = FALSE,
show.legend = NA, inherit.aes = TRUE) {
layer(data = data, mapping = mapping, stat = stat, geom = GeomSplitViolin,
position = position, show.legend = show.legend, inherit.aes = inherit.aes,
params = list(trim = trim, scale = scale, draw_quantiles = draw_quantiles, na.rm = na.rm, ...))
}
# Add labels 'n = ...'
give_n = function(x, y_lo = 12) {
data.frame(y = y_lo,
label = paste("n =", length(x)))
}
# Plot data
ggplot(my_data, aes(variable, y, fill = value)) +
geom_split_violin() +
facet_grid(type ~ ., scales = "free_y") +
stat_summary(fun.data = give_n, aes(x = as.factor(variable)),
geom = "text", position = position_nudge(x = c(-0.25, 0.25)))
#创建数据
种子集(12345)
my_data=data.frame(
y=c(rnorm(1000,15)),
类型=c(代表(“A”,635),代表(“B”,365)),
变量=c(代表(“p1”,151),代表(“p2”,287),代表(“p3”,197),
代表(“p1”,73),代表(“p2”,181),代表(“p3”,111)),
值=c(代表(“0”,89),代表(“1”,62),
代表(“0”,151),代表(“1”,136),
代表(“0”,101),代表(“1”,96),
代表(“0”,39),代表(“1”,34),
代表(“0”,181),
代表(“0”,108),代表(“1”,3)))
#从上面的链接创建geom_split_小提琴函数的代码
库('ggplot2')
对于b/p2,您有一个长度为1的标签,但有一个长度为2的微移(x=c(-0.25,0.25)
),因此它会忽略其余部分。您可以尝试位置\u道奇(宽度=1)
而不是前进!好极了非常感谢你!如果你想回答这个问题,我会打勾并投票表决。