对awk的R系统调用失败

我有一个日志文件，我们叫它mylogfile.txt

格式是 日期时间戳，然后是分号分隔符，然后是其他一些我不关心的东西，就本练习而言

例如（这是日志文件中的全部一行-不确定如何在道歉中这样表示）

我目前尝试的只是一个概念验证示例。我希望解析文件，颠倒行顺序，并在输出中返回两列-

1） 只是从第1列解析的时间戳（这是一种日期时间格式，因此我需要放弃日期部分）

2） 从午夜开始以秒表示的时间戳，以毫秒精度表示（和时间戳本身的粒度一致）

因此，从下面的单线示例中，输出为eg

23:59:43.158,86383.158

我可以走到一半。我可以使用在cygwin中运行良好的语法构造对awk的调用（自然去掉了R包装），但在R中不起作用

testawk<-paste0("tac ", mylogfile.txt, " | awk 'BEGIN {FS=\"-|;|:\"} {OMFT=\"%.3f\"} {print $2 \":\" $3 \":\" $4 \",\" (3600*$2)+(60*$3)+$4}' ")

getawk<-as.data.frame(system(testawk, intern=TRUE, show.output.on.console = FALSE))

---

testawk在尝试将其他语言与R一起使用时，例如Python，经常会发生这种情况。如果您没有将路径添加到Windows系统路径，那么您就没有告诉RStudio在哪里可以找到可执行文件

Cygwin的根目录通常位于
C:\cygwin64
（但可能因安装而异），因此请查找安装并查找
bin
文件夹。其中应该有awk可执行文件，但它通常只是指向
gawk
可执行文件的符号链接（请验证您自己），以便将其添加到路径中，例如：

Sys.setenv(PATH = paste("C:/cygwin64/bin/gawk", Sys.getenv("PATH"), sep = ":"))

注意：这不会永久添加，因此您必须在每个会话开始时启动或永久识别它。
在尝试将其他语言与R（例如Python）一起使用时，通常会发生这种情况。如果您没有将路径添加到Windows系统路径，则您没有告诉RStudio在何处查找可执行文件

Cygwin的根目录通常位于
C:\cygwin64
（但可能因安装而异），因此请查找安装并查找
bin
文件夹。其中应该有awk可执行文件，但它通常只是指向
gawk
可执行文件的符号链接（请验证您自己），以便将其添加到路径中，例如：

Sys.setenv(PATH = paste("C:/cygwin64/bin/gawk", Sys.getenv("PATH"), sep = ":"))

注意：这不会永久添加，因此您必须在每次会话开始时启动或永久识别它。
听起来好像根本找不到“awk”，可能它不在您的路径中。请尝试输入awk的完整路径，例如/usr/bin/awk。我没有使用Windows和Cygwin，因此您的实际路径肯定会不同。
像“awk”这样的ound根本找不到，可能它不在您的路径中。请尝试输入awk的完整路径，例如/usr/bin/awk。我没有使用Windows和Cygwin，因此您的实际路径肯定会有所不同。
只需在R中执行所有操作：

c(
  "20170710-10:31:26.121;B@13.43434@1000000.0@20170710-21:15:53.23@@2017071023:59:43.158@@T@20170710-23:59:43.156#B@13.41834@4000000.0@20170710-21:15:53.23@@20170710-23:59:43.158@@T@20170710-23:59:43.156#A@13.47274@1000000.0@20170710-21:15:53.23@@20170710-23:59:43.158@@T@20170710-23:59:43.156#A@13.48874@4000000.0@20170710-21:15:53.23@@20170710-23:59:43.158@@T@20170710-23:59:43.156#",
  "20170710-23:59:43.158;B@13.43434@1000000.0@20170710-21:15:53.23@@2017071023:59:43.158@@T@20170710-23:59:43.156#B@13.41834@4000000.0@20170710-21:15:53.23@@20170710-23:59:43.158@@T@20170710-23:59:43.156#A@13.47274@1000000.0@20170710-21:15:53.23@@20170710-23:59:43.158@@T@20170710-23:59:43.156#A@13.48874@4000000.0@20170710-21:15:53.23@@20170710-23:59:43.158@@T@20170710-23:59:43.156#"
) -> log_lines

# you'd get the above with `log_lines <- readLines('filename')`

matched <- stringi::stri_match_first_regex(log_lines, "([[:digit:]]+:[[:digit:]]+:[[:digit:]]+\\.[[:digit:]]+)")[,2]

cat(
  rev(
    sprintf(
      "%s,%s\n", 
      matched, 
      lubridate::hms(matched) %>% 
        as.numeric() %>% 
        sprintf("%9.3f", .)
    )
  ),
  sep=""
)

而且，您可以
cat
将其存储到文件或存储在数据帧中（等等）

我想您可能更熟悉
awk
，但使用它绝对没有意义。
只需在R:

c(
  "20170710-10:31:26.121;B@13.43434@1000000.0@20170710-21:15:53.23@@2017071023:59:43.158@@T@20170710-23:59:43.156#B@13.41834@4000000.0@20170710-21:15:53.23@@20170710-23:59:43.158@@T@20170710-23:59:43.156#A@13.47274@1000000.0@20170710-21:15:53.23@@20170710-23:59:43.158@@T@20170710-23:59:43.156#A@13.48874@4000000.0@20170710-21:15:53.23@@20170710-23:59:43.158@@T@20170710-23:59:43.156#",
  "20170710-23:59:43.158;B@13.43434@1000000.0@20170710-21:15:53.23@@2017071023:59:43.158@@T@20170710-23:59:43.156#B@13.41834@4000000.0@20170710-21:15:53.23@@20170710-23:59:43.158@@T@20170710-23:59:43.156#A@13.47274@1000000.0@20170710-21:15:53.23@@20170710-23:59:43.158@@T@20170710-23:59:43.156#A@13.48874@4000000.0@20170710-21:15:53.23@@20170710-23:59:43.158@@T@20170710-23:59:43.156#"
) -> log_lines

# you'd get the above with `log_lines <- readLines('filename')`

matched <- stringi::stri_match_first_regex(log_lines, "([[:digit:]]+:[[:digit:]]+:[[:digit:]]+\\.[[:digit:]]+)")[,2]

cat(
  rev(
    sprintf(
      "%s,%s\n", 
      matched, 
      lubridate::hms(matched) %>% 
        as.numeric() %>% 
        sprintf("%9.3f", .)
    )
  ),
  sep=""
)

而且，您可以
cat
将其存储到文件或存储在数据帧中（等等）

我想你可能更熟悉
awk
，但使用它绝对没有意义。
为什么要使用
awk
呢？你可以在R中不费吹灰之力地使用它。为什么要在R中使用
awk
呢？你可以在R中不费吹灰之力地使用它。/usr/bin/awk已返回。我将添加这一点。谢谢（也请参见下面的海报）。遗憾的是，它不起作用。仍然出现“未找到awk”错误。由于我正在windows box上运行所有这些，我是否需要一个更“windowey”的文件路径？好的，谢谢。原来它是在c:/installs/cygwin64/bin/awk中，所以我尝试使用它运行命令。仍然没有乐趣。尝试重新启动RStudio。是否使用大写c？您还需要每隔一段时间运行该命令当你重新启动RStudio时，因为这不会永久地添加到路径中。好吧，从另一个角度来看，成功了。我查看了awk可执行文件，它似乎只是一个到gawk的链接。因此我尝试使用gawk调用R命令，这似乎很好。就每次都需要运行该命令而言，我想我可以轻松地nough将它添加到我的启动脚本中，这是我日常工作的一部分。非常感谢您的帮助。最终到达了那里。/usr/bin/awk已返回。我将添加它。谢谢（还有下面的海报）。遗憾的是，它不起作用。仍然出现“未找到awk”错误。由于我正在windows box上运行所有这些，我是否需要一个更“windowey”的文件路径？好的，谢谢。原来它是在c:/installs/cygwin64/bin/awk中，所以我尝试使用它运行命令。仍然没有乐趣。尝试重新启动RStudio。是否使用大写c？您还需要每隔一段时间运行该命令当你重新启动RStudio时，因为这不会永久地添加到路径中。好吧，从另一个角度来看，成功了。我查看了awk可执行文件，它似乎只是一个到gawk的链接。因此我尝试使用gawk调用R命令，这似乎很好。就每次都需要运行该命令而言，我想我可以轻松地不，把它添加到我的启动脚本中，这是我日常工作的一部分。非常感谢你的帮助。最终达到了目的。谢谢。我确实知道如何在R中做这件事，但问题是具体如何调用awk。正如我前面所说的，那个特定的例子只是那个。一个例子。我还有其他用例。谢谢。我确实知道如何调用awk在R中做这件事，但问题是具体如何调用awk。正如我前面所说的，那个特定的例子仅仅是那个。一个例子。我还有其他的用例。
10:31:26.121,37886.121
23:59:43.158,86383.158