mac中Rcpp包中的dyn.load错误
我在加载编译对象Rcpp编译对象时遇到问题。我正在从源代码处编译RcppSMC包。我mac中Rcpp包中的dyn.load错误,r,macos,installation,clang,rcpp,R,Macos,Installation,Clang,Rcpp,我在加载编译对象Rcpp编译对象时遇到问题。我正在从源代码处编译RcppSMC包。我 Error in dyn.load("mylib.so") : unable to load shared object '/Users/avi/softwares/RcppSMC/src/mylib.so': dlopen(/Users/avi/softwares/RcppSMC/src/mylib.so, 6): Symbol not found: __ZNSoD0Ev Referenced
Error in dyn.load("mylib.so") :
unable to load shared object '/Users/avi/softwares/RcppSMC/src/mylib.so':
dlopen(/Users/avi/softwares/RcppSMC/src/mylib.so, 6): Symbol not found: __ZNSoD0Ev
Referenced from: /Users/avi/softwares/RcppSMC/src/mylib.so
Expected in: flat namespace
in /Users/avi/softwares/RcppSMC/src/mylib.so
我正在使用铿锵来编译下面的verson。我认为这是一个编译问题,因为如果我从CRAN dyn下载mac os二进制文件,load可以工作
Apple LLVM version 5.0 (clang-500.2.79) (based on LLVM 3.3svn)
Target: x86_64-apple-darwin13.0.0
clang++ -I/Library/Frameworks/R.framework/Resources/include -DNDEBUG -I../inst/include -I/usr/local/include -I"/Users/avi/Library/R/3.0/library/Rcpp/include" -fPIC -g -O3 -pipe -std=c++0x -Wall -pedantic -c blockpfgaussianopt.cpp -o blockpfgaussianopt.o
.....
clang++ -dynamiclib -Wl,-headerpad_max_install_names -undefined dynamic_lookup -single_module -multiply_defined suppress -L/usr/local/lib -L/usr/local/lib -o mylib.so blockpfgaussianopt.o history.o pflineart.o pfnonlinbs.o smc-exception.o /Users/avi/Library/R/3.0/library/Rcpp/lib/libRcpp.a -F/Library/Frameworks/R.framework/.. -framework R -Wl,-framework -Wl,CoreFoundation
安装到/Users/avi/Library/R/3.0/Library/RcppSMC/libs
这是一个奇怪的问题,因为sourceCpp正在计算机中工作。如果您试图安装一个从源代码链接到
Rcpp
的软件包,您可能还需要从源代码安装Rcpp
假设您使用的是OS X Mavericks,在StackOverflow上也有类似的帖子,但都存在类似的问题。我的一位同事也遇到了同样的问题 我们尝试了在互联网上找到的所有可能的解决方案 我们最终得出结论,是新版本的Mac(Mojave)引发了此类问题 他降级到Sierra并重新安装了所有设备。
这解决了他的问题。谢谢凯文。我真傻。我确实读过关于编译Rcpp的文章,应该从源代码安装。但忽视了它,认为它是推荐的,没有必要的。从源代码安装时,它肯定工作顺利。没问题。由于旧的(和CRAN使用的)编译器和新的
clang
编译器之间的ABI兼容性,它直到最近才成为MacOSX Mavericks用户所必需的。希望问题能通过R3.1.0解决。我也遇到过同样的问题,而你的解决方案正是我为了让它正常工作所做的。感谢您的发帖,因为我最初认为有一个我没有发现的特定MacOS版本的解决方案。可能有一些解决方案,但我们没有找到:/