为什么我的glm在使用as.factor()时仍在分析多变量?

为什么我的glm在使用as.factor()时仍在分析多变量?,r,glm,R,Glm,我正在尝试运行一个glm,研究食物类型、栖息地和饥饿期对蚂蚁食物偏好的影响,但是我只想将食物类型作为一个单一因素,尽管我为蚂蚁提供了5种食物。我在食物变量上使用了as.factor,但它似乎仍然不起作用!我想要一个单一的p值来表示食物对个体的影响。我错过什么了吗 NumofAnts FoodType Trial SiteType 1 0 Pink 1 natural 2 4 Pink 1 natural 3

我正在尝试运行一个glm,研究食物类型、栖息地和饥饿期对蚂蚁食物偏好的影响,但是我只想将食物类型作为一个单一因素,尽管我为蚂蚁提供了5种食物。我在食物变量上使用了as.factor,但它似乎仍然不起作用!我想要一个单一的p值来表示食物对个体的影响。我错过什么了吗

  NumofAnts FoodType Trial SiteType
1         0     Pink     1  natural
2         4     Pink     1  natural
3         5     Pink     1  natural
4         4     Pink     1  natural
5         8     Pink     1  natural
6         5     Pink     1  natural
fit | z |)
(截距)1.46177 0.08031 18.202<2e-16***
as.因子(食品类型)蓝色-0.66665 0.06824-9.769<2e-16***
as.因子(食品类型)绿色-0.29987 0.06093-4.922 8.57e-07***
as.系数(食品类型)黄色-0.28086 0.06060-4.635 3.57e-06***
as.系数(食品类型)红色-0.92502 0.07459-12.401<2e-16***
试用版0.19355 0.04327 4.473 7.73e-06***
SiteTypeurban-0.19730 0.04328-4.558 5.16e-06***
---
签名。代码:0'***'0.001'***'0.01'*'0.05'.'0.1''1

当变量为数值时,glm将估计一个系数(因此为一个p值)。但是,当变量是分类变量时(如您的案例中的
食品
),它将为变量的每个级别(除一个之外)计算一个系数。在您的例子中,
食品
有5个级别,因此估计了4个系数(4个p值)。当变量为数值时,glm将估计一个系数(一个p值)。但是,当变量是分类变量时(如您的案例中的
食品
),它将为变量的每个级别(除一个之外)计算一个系数。在您的例子中,
food
有5个级别,因此估计了4个系数(4个p值)。

看起来您的
FoodType
变量不是有序的,因此当前的虚拟编码方法看起来是合适的。您可以拟合包含和不包含
FoodType
的模型,并使用
anova
对其进行比较,以了解包含这些术语的总体影响。您的
FoodType
变量看起来不是有序的,因此当前的虚拟编码方法看起来是合适的。您可以拟合包含和不包含
FoodType
的模型,并使用
anova
对其进行比较,以了解包含这些术语的总体影响。
fit<-glm(NumofAnts~as.factor(FoodType) + Trial + SiteType, 
family=poisson(link=log), data=stacked1)
glm(formula = NumofAnts ~ as.factor(FoodType) + Trial + SiteType, 
    family = poisson(link = log), data = stacked1)

Deviance Residuals: 
    Min       1Q   Median       3Q      Max  
-3.5644  -2.2495  -1.0023   0.8588   8.8051  

Coefficients:
                          Estimate Std. Error z value Pr(>|z|)    
(Intercept)                1.46177    0.08031  18.202  < 2e-16 ***
as.factor(FoodType)Blue   -0.66665    0.06824  -9.769  < 2e-16 ***
as.factor(FoodType)Green  -0.29987    0.06093  -4.922 8.57e-07 ***
as.factor(FoodType)Yellow -0.28086    0.06060  -4.635 3.57e-06 ***
as.factor(FoodType)Red    -0.92502    0.07459 -12.401  < 2e-16 ***
Trial                      0.19355    0.04327   4.473 7.73e-06 ***
SiteTypeurban             -0.19730    0.04328  -4.558 5.16e-06 ***
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Signif. codes:  0 ‘***’ 0.001 ‘**’ 0.01 ‘*’ 0.05 ‘.’ 0.1 ‘ ’ 1