如何在R包中正确地包含依赖项?
我现在花了几个小时试图在R中构建一个包,但对于我的进度有点绝望。我很快构建了一个没有依赖项的包,一切都很好。根据几篇文章中的建议,我正在使用R Studio、devtools和Roxygen2(在Windows上)。对于依赖项,我在检查时会遇到问题(例如,使用devtools::CHECK()): 正在检查R代码中的依赖项。。。注意导入字段中的命名空间 不是从“ggplot2”导入的所有已声明的导入都应使用。 请参阅“创建R”一章中有关描述文件的信息 “编写R扩展”手册的“包” 此外,check()删除命名空间中的如何在R包中正确地包含依赖项?,r,dependencies,package,R,Dependencies,Package,我现在花了几个小时试图在R中构建一个包,但对于我的进度有点绝望。我很快构建了一个没有依赖项的包,一切都很好。根据几篇文章中的建议,我正在使用R Studio、devtools和Roxygen2(在Windows上)。对于依赖项,我在检查时会遇到问题(例如,使用devtools::CHECK()): 正在检查R代码中的依赖项。。。注意导入字段中的命名空间 不是从“ggplot2”导入的所有已声明的导入都应使用。 请参阅“创建R”一章中有关描述文件的信息 “编写R扩展”手册的“包” 此外,check
import(ggplot2)
行。如果我检查(document=F),它会给出一个关于未加载的摘要
包的神秘错误。我读了《编写R扩展》——1.1.3包依赖关系和Hadley的Wiki关于如何编写包的文章,但没有解决我的问题。CRAN的其他R包的描述和名称空间文件对我来说没有什么不同(在我看来)
问题:我做错了什么?很抱歉提出这样一个基本的问题,但我不知所措,到目前为止,我看到的大多数循序渐进的教程都在解释依赖关系之前停止了
到目前为止,我有3个文件:描述:
Package: test
Type: Package
Title: Foo
Version: 1.0
Date: 2014-03-21
Author: Bar
Maintainer: Foo <bar@mail.com>
Description: Blubb
Imports:
ggplot2
License: GPL-3
R文件:
#' Extension of compare to include NULLs
#'
#' Works as an extension to usual compare
#' Compares two basic objects which in addition to usual compare can be NULL
#' Intuitive output: TRUE if both are equal or NULL resp., FALSE if both are unequal or only one is NULL
#'
#' @param obj1 Basic object like \code{numeric, char, boolean, NULL}
#' @param obj2 Basic object like \code{numeric, char, boolean, NULL}
#' @keywords compare
#' @export
#' @examples
#' is.equal.null(5,5) # TRUE
#' is.equal.null(5,NULL) # FALSE
#' is.equal.null(NULL,NULL) # TRUE
is.equal.null <- function(obj1, obj2) {
# Small helper function to generalize comparison to comparison of NULL
# returns TRUE if both are NULL, and FALSE if only one of the objects is NULL
bool <- obj1==obj2
#qplot(obj1)
if (length(bool)) return(bool)
if (is.null(obj1) & is.null(obj2)) return(TRUE)
return(FALSE)
}
比较的扩展以包括空值
#'
#'作为常规比较的扩展
#'比较两个基本对象,除通常的比较外,这两个对象可以为空
#'直观输出:如果两者相等或为空,则为TRUE;如果两者不相等或只有一个为空,则为FALSE
#'
#'@param obj1基本对象,如\code{numeric,char,boolean,NULL}
#'@param obj2基本对象,如\code{numeric,char,boolean,NULL}
#“@关键字比较
#“@出口
#“@示例
#'is.equal.null(5,5)#TRUE
#'is.equal.null(5,null)#FALSE
#'is.equal.null(null,null)#TRUE
is.equal.null您需要在两个位置声明导入:
Imports: ggplot2, pkg1, pkg2
import(ggplot2)
或者避免名称空间冲突
importFrom(ggplot2, geom_point)
您可以让roxygen2使用@import
和@importFrom
标记来维护名称空间文件importFrom(ggplot2, geom_point)