R “之后如何绘制(带错误条)”;“聚合”吗;?
我有两个维度的数据(2次治疗x 3天),目标是用两条线绘制线图,表示平均值和误差条。然而,当我使用“绘图”来绘制平均值时,结果是3 X 3平方的图形(不知道它是什么) 数据: 我使用R “之后如何绘制(带错误条)”;“聚合”吗;?,r,R,我有两个维度的数据(2次治疗x 3天),目标是用两条线绘制线图,表示平均值和误差条。然而,当我使用“绘图”来绘制平均值时,结果是3 X 3平方的图形(不知道它是什么) 数据: 我使用aggregate计算平均值和标准误差。然而,当我使用plot时,结果很奇怪 dta=read.table(file ='dta.csv', header = T, sep = ',') dta.mean=aggregate(dta[,-1:-2], list(dta$Treatment),mean) plot(
aggregate
计算平均值和标准误差。然而,当我使用plot
时,结果很奇怪
dta=read.table(file ='dta.csv', header = T, sep = ',')
dta.mean=aggregate(dta[,-1:-2], list(dta$Treatment),mean)
plot(dta.mean[1,2:4])
我期望线图由两条线组成(一条是处理A,另一条是处理B),y值是带有误差条的平均值。
请帮帮我:(非常感谢
图1:这是错误的结果
图2:预期的一个
让我们一步一步来做这件事。我希望这会对你有所帮助 首先,让我们看看
aggregate
方法的结果是什么:
Group.1 D1 D2 D3
1 A 5.000000 6.000000 5.666667
2 B 2.666667 1.666667 2.666667
然后,对plot
的调用包括dta.mean[1,2:4]
以便选择第1行和第2列到第4列进行绘图(作为数据帧):
请注意,这仅包括组“A”(第1行)和3个数值变量(用于D1、D2和D3)
在数据帧上调用plot
时,您将得到问题中提供的散点图矩阵。这显示了6个散点图(D1与D2、D2与D1、D1与D3、D3与D1、D2与D3、D3与D2)。这6个图中的每一个都只有一个点。例如,D1与D2的比值为D1=5,D2=6
以下是我将采取的方法:
首先,我将melt
数据(restrape2
package):
这将为您提供以下用于打印的信息:
Treatment variable value
1 A D1 5.000000
2 B D1 2.666667
3 A D2 6.000000
4 B D2 1.666667
5 A D3 5.666667
6 B D3 2.666667
使用ggplot2
:
library(ggplot2)
ggplot(dta.mean, aes(x = variable, y = value, group = Treatment, col = Treatment)) +
geom_line()
要执行errorbars,您需要再次聚合数据(类似于为means所做的操作),并可能使用geom\u errorbar
我希望这会对你有所帮助。让我们一步一步来。我希望这会对你有所帮助 首先,让我们看看
aggregate
方法的结果是什么:
Group.1 D1 D2 D3
1 A 5.000000 6.000000 5.666667
2 B 2.666667 1.666667 2.666667
然后,对plot
的调用包括dta.mean[1,2:4]
以便选择第1行和第2列到第4列进行绘图(作为数据帧):
请注意,这仅包括组“A”(第1行)和3个数值变量(用于D1、D2和D3)
在数据帧上调用plot
时,您将得到问题中提供的散点图矩阵。这显示了6个散点图(D1与D2、D2与D1、D1与D3、D3与D1、D2与D3、D3与D2)。这6个图中的每一个都只有一个点。例如,D1与D2的比值为D1=5,D2=6
以下是我将采取的方法:
首先,我将melt
数据(restrape2
package):
这将为您提供以下用于打印的信息:
Treatment variable value
1 A D1 5.000000
2 B D1 2.666667
3 A D2 6.000000
4 B D2 1.666667
5 A D3 5.666667
6 B D3 2.666667
使用ggplot2
:
library(ggplot2)
ggplot(dta.mean, aes(x = variable, y = value, group = Treatment, col = Treatment)) +
geom_line()
要执行errorbars,您需要再次聚合数据(类似于为means所做的操作),并可能使用geom\u errorbar
我希望这会对您有所帮助。您能添加一张预期和当前绘图的图片吗?@NelsonGon当然,我已经编辑了内容,图片都在开头!看看为什么结果会是这样?有人能帮我指出编码中的错误吗?谢谢>您能添加预期和当前绘图的图片吗?@NelsonGon当然,我已经编辑了内容,图像就在开头!看看为什么结果会是这样?有人能帮我指出编码中的错误吗?谢谢>
library(ggplot2)
ggplot(dta.mean, aes(x = variable, y = value, group = Treatment, col = Treatment)) +
geom_line()