组合P值的Stouffer-Liptak方法

我需要使用Stouffer-Liptak方法结合p值进行荟萃分析。我的数据由一个数据框组成，其中行是基因，列包含P值。下面是模拟插图

Gene  Study 1  Study 2  Study 3
a     0.03     0.001    0.3
b     0.2      0.1      0.02
c     0.04     0.05     0.03

总共有25000个基因，我需要一段代码，使用Stouffer-Liptak方法为所有25000个基因生成组合的p.值，每行一个。任何关于如何使用R和Bioconductor应用此方法的建议都将受到欢迎

干杯，

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Ankur.

在

MetaDE

中的

MetaDE.rawdata

函数有Stouffer.

键入

？在R中应用

，或者在右上角的搜索框中搜索

[R]应用

，或者你是在问如何实际执行Stouffer-Liptak方法？我实际上是在问如何执行该方法。看起来很好，谢谢。这看起来更像是一个统计问题，因此更适合stats.statexchange.Try

library（“sos”）；findFn（“Liptak”）