合并(rbind)数据帧并创建具有原始数据帧名称的列

合并(rbind)数据帧并创建具有原始数据帧名称的列,r,R,我有几个要按行组合的数据帧。在生成的单个数据框中,我想创建一个新变量,标识观察来自哪个数据集 # original data frames df1 <- data.frame(x = c(1, 3), y = c(2, 4)) df2 <- data.frame(x = c(5, 7), y = c(6, 8)) # desired, combined data frame df3 <- data.frame(x = c(1, 3, 5, 7), y = c(2, 4, 6

我有几个要按行组合的数据帧。在生成的单个数据框中,我想创建一个新变量,标识观察来自哪个数据集

# original data frames
df1 <- data.frame(x = c(1, 3), y = c(2, 4))
df2 <- data.frame(x = c(5, 7), y = c(6, 8))

# desired, combined data frame
df3  <- data.frame(x = c(1, 3, 5, 7), y = c(2, 4, 6, 8),
                   source = c("df1", "df1", "df2", "df2")
# x y source
# 1 2    df1
# 3 4    df1
# 5 6    df2
# 7 8    df2
原始数据帧
df1我不确定这样的函数是否已经存在,但这似乎起到了作用:

bindAndSource <-  function(df1, df2) { 
  df1$source <- as.character(match.call())[[2]]
  df2$source <- as.character(match.call())[[3]]
  rbind(df1, df2)
}


警告:这在类似于呼叫的
*aply
中不起作用。这并不完全是您要求的,但非常接近。将对象放入命名列表中,并使用
do.call(rbind…)

请注意,行名称现在反映了源
data.frame
s

更新:使用
cbind
rbind
另一个选项是创建如下所示的基本函数:

AppendMe <- function(dfNames) {
  do.call(rbind, lapply(dfNames, function(x) {
    cbind(get(x), source = x)
  }))
}
更新2:使用“gdata”软件包中的
组合
更新3:使用“数据表”中的
rbindlist
现在可以使用的另一种方法是使用“data.table”中的
rbindlist
及其
idcol
参数。这样,方法可以是:

> rbindlist(mget(ls(pattern = "df\\d+")), idcol = TRUE)
   .id x y
1: df1 1 2
2: df1 3 4
3: df2 5 6
4: df2 7 8
更新4:使用“purrr”中的
map_df
rbindlist
类似,您也可以使用“purrr”中的
map_df
I
c
作为应用于每个列表元素的函数

> mget(ls(pattern = "df\\d+")) %>% map_df(I, .id = "src")
Source: local data frame [4 x 3]

    src     x     y
  (chr) (int) (int)
1   df1     1     2
2   df1     3     4
3   df2     5     6
4   df2     7     8

其他两个答案的混合:

df1 <- data.frame(x = 1:3,y = 1:3)
df2 <- data.frame(x = 4:6,y = 4:6)

> foo <- function(...){
    args <- list(...)
    result <- do.call(rbind,args)
    result$source <- rep(as.character(match.call()[-1]),times = sapply(args,nrow))
    result
 }

> foo(df1,df2,df1)
  x y source
1 1 1    df1
2 2 2    df1
3 3 3    df1
4 4 4    df2
5 5 5    df2
6 6 6    df2
7 1 1    df1
8 2 2    df1
9 3 3    df1

df1另一个解决方法是在plyr包中使用ldply

df1 <- data.frame(x = c(1,3), y = c(2,4))
df2 <- data.frame(x = c(5,7), y = c(6,8))
list = list(df1 = df1, df2 = df2)
df3 <- ldply(list)

df3
  .id x y
  df1 1 2
  df1 3 4
  df2 5 6
  df2 7 8

df1另一种使用
dplyr的方法:

df1 <- data.frame(x = c(1,3), y = c(2,4))
df2 <- data.frame(x = c(5,7), y = c(6,8))

df3 <- dplyr::bind_rows(list(df1=df1, df2=df2), .id = 'source')

df3
Source: local data frame [4 x 3]

  source     x     y
   (chr) (dbl) (dbl)
1    df1     1     2
2    df1     3     4
3    df2     5     6
4    df2     7     8

df1尽管这里已经有一些很好的答案,但我只想添加我一直在使用的答案。它是base
R
,因此如果您想在包中使用它,它的限制可能更小,而且它比其他一些base
R
解决方案要快一点

dfs <- list(df1 = data.frame("x"=c(1,2), "y"=2),
            df2 = data.frame("x"=c(2,4), "y"=4),
            df3 = data.frame("x"=2, "y"=c(4,5,7)))

> microbenchmark(cbind(do.call(rbind,dfs), 
                       rep(names(dfs), vapply(dfs, nrow, numeric(1)))), times = 1001)
Unit: microseconds
     min      lq     mean  median      uq      max neval
 393.541 409.083 454.9913 433.422 453.657 6157.649  1001

我不是100%确定,但我相信速度的提高是因为只需调用一次
cbind
,而不是每个数据帧调用一次。

哦,我喜欢这种方法!我还不习惯使用match.call,但是我读的越多,它在创建函数方面就越重要!谢谢你,伙计@PaddyMaloney,使用
匹配。谨慎地呼叫
。)是的,这与我使用append函数时遇到的问题完全相同。从这里可以创建一个新变量=row.names,然后在句点之后解析所有内容。谢谢你的快速回复!对我来说,这为数据帧提供了一个数字(基于调用的顺序),而不是实际的数据帧名称:o
df1 <- data.frame(x = 1:3,y = 1:3)
df2 <- data.frame(x = 4:6,y = 4:6)

> foo <- function(...){
    args <- list(...)
    result <- do.call(rbind,args)
    result$source <- rep(as.character(match.call()[-1]),times = sapply(args,nrow))
    result
 }

> foo(df1,df2,df1)
  x y source
1 1 1    df1
2 2 2    df1
3 3 3    df1
4 4 4    df2
5 5 5    df2
6 6 6    df2
7 1 1    df1
8 2 2    df1
9 3 3    df1
df1 <- data.frame(x = c(1,3), y = c(2,4))
df2 <- data.frame(x = c(5,7), y = c(6,8))
list = list(df1 = df1, df2 = df2)
df3 <- ldply(list)

df3
  .id x y
  df1 1 2
  df1 3 4
  df2 5 6
  df2 7 8
df1 <- data.frame(x = c(1,3), y = c(2,4))
df2 <- data.frame(x = c(5,7), y = c(6,8))

df3 <- dplyr::bind_rows(list(df1=df1, df2=df2), .id = 'source')

df3
Source: local data frame [4 x 3]

  source     x     y
   (chr) (dbl) (dbl)
1    df1     1     2
2    df1     3     4
3    df2     5     6
4    df2     7     8
dfs <- list(df1 = data.frame("x"=c(1,2), "y"=2),
            df2 = data.frame("x"=c(2,4), "y"=4),
            df3 = data.frame("x"=2, "y"=c(4,5,7)))

> microbenchmark(cbind(do.call(rbind,dfs), 
                       rep(names(dfs), vapply(dfs, nrow, numeric(1)))), times = 1001)
Unit: microseconds
     min      lq     mean  median      uq      max neval
 393.541 409.083 454.9913 433.422 453.657 6157.649  1001
> microbenchmark(do.call(rbind, 
                         lapply(names(dfs), function(x) cbind(dfs[[x]], source = x))), 
                 times = 1001)
Unit: microseconds
      min      lq     mean  median       uq      max neval
  844.558 870.071 1034.182 896.464 1210.533 8867.858  1001