用于焦点统计(焦点,“光栅”包,R)的自身函数提供不正确的输出
我是R和编程的初学者。所以我认为问题很简单,但我无法找到答案或解决它 我有光栅(100*100个单元格)。我需要在移动窗口(例如,窗口大小=21)通过2D DFT获得谐波幅值的中值。 我在光栅包中找到了焦距函数。对于这个函数,我可以编写自己的函数,该函数采用系列值(窗口中的光栅值)并返回整个窗口的单个值用于焦点统计(焦点,“光栅”包,R)的自身函数提供不正确的输出,r,geospatial,raster,R,Geospatial,Raster,我是R和编程的初学者。所以我认为问题很简单,但我无法找到答案或解决它 我有光栅(100*100个单元格)。我需要在移动窗口(例如,窗口大小=21)通过2D DFT获得谐波幅值的中值。 我在光栅包中找到了焦距函数。对于这个函数,我可以编写自己的函数,该函数采用系列值(窗口中的光栅值)并返回整个窗口的单个值 r <- raster(matrix(rnorm(10000), nrow = 100, ncol = 100)) # creation of raster win <- 21 #
r <- raster(matrix(rnorm(10000), nrow = 100, ncol = 100)) # creation of raster
win <- 21 # setting the window size
spectr <- function(d) {
return(median(abs(spec.fft(x = 1:win, y = 1:win, z = (d - mean(d)))$A)))
} # i think "d" - the matrix of raster values in the window border
focal(x = r, w = matrix(1, win, win), fun = spectr())
首先,要使用前面在
focal()
中定义的函数,只需删除函数名后的括号()
其次,使用spectral::spec.fft
函数,它要求z
参数为矩阵。然而,正如我们从?focal
中学到的,focal转发了一个值向量:
fun函数应该包含多个数字,并返回一个数字
因此,您必须自己生成所需的矩阵
参见此示例(但是,请检查输出的有效性):
谢谢你,洛基!这真的很简单。但我认为函数“spectr”中的错误。您的代码正常工作)
install.packages("spectral")
library(spectral)
spectr <- function(d) {
return(median(abs(spec.fft(x = 1:win, y = 1:win,
z = (matrix(d, ncol = win, nrow = win) - mean(d)))$A
# eventually you have to reorder or transpose the matrix
# if its order has some impact on spec.fft
)))
}
focal(x = r, w = matrix(1, win, win), fun = spectr)
# class : RasterLayer
# dimensions : 100, 100, 10000 (nrow, ncol, ncell)
# resolution : 0.01, 0.01 (x, y)
# extent : 0, 1, 0, 1 (xmin, xmax, ymin, ymax)
# coord. ref. : NA
# data source : in memory
# names : layer
# values : 0.03341064, 0.04557778 (min, max)