从Rscript以交互方式运行R

我正在尝试从Rscript启动一个闪亮的应用程序或交互式.Rmd文档。然而，我得到的只是一条信息

正在收听：

我相信这是因为R是以交互模式运行的（关于这一点）。如何编写正确的Rscript，使以下任一项都能工作

我的剧本

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如果我正确理解了您的问题，我就能够用它来实现这一点，我使用它来代替围绕R编写脚本的任务。

Rscript

。我正在运行CentOS 7，根据您问题中的代码，看起来您是在一台类似Unix的机器上，因此不应该是问题。为了最小化再现性，我使用了RStudio提供的默认闪亮应用程序和基于闪亮的Rmarkdown模板，将它们分别保存为

testapp

（项目/应用程序目录名）和

testRMD.rmd

。然后，我有以下脚本：

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第r页

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testRMD.r

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设置这些文件的权限，以便可以执行这些文件-

[nathan@nrussell R]$ chmod +x testapp.r testRMD.r

（

chmod+u…

应该足够了，但无论如何…），并且您应该设置好从终端运行它们，等等

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对于我省略的

Rmd

文件，还有一些额外的命令行输出，但我确信如果需要，可以很容易地抑制这些输出。无论如何，这似乎工作正常-Shining应用程序和Rmarkdown应用程序都是交互式的，就像从RStudio启动时一样-但是如果您有其他想法，请澄清。

谢谢@nrussell，您的示例对我帮助很大

下面是我在Windows 10上启动交互式降价文档的解决方案

REM Change to correct directory
cd "C:\Users\me\Documents\project_folder\"

REM Print files available (not required, but helpful)
dir

REM Point system to R's Pandoc with Rscript then launch
"C:\Program Files\R\R-4.0.3\bin\Rscript.exe" -e ^
"Sys.setenv(RSTUDIO_PANDOC='C:/Users/me/Documents/RStudio/bin/pandoc'); rmarkdown::run(file = 'myInteractiveMarkdown.Rmd', shiny_args = list(launch.browser = TRUE, host = '127.0.0.1'))"

我发现我最初有两个错误：

当我没有将系统环境指向R的pandoc时，它给出了错误消息

错误pandoc版本1.12.3或更高版本是必需的

，我使用说明解决了这个问题

当我在

shinny_args

中设置端口时，bat文件的后续执行将得到一个错误，即端口已经繁忙

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谢谢！出于某种原因，我只是假设launch.browser总是正确的（facepalm）。我还没试过littler，但看起来很不错。我需要这是共享的windows以及现在虽然。在尝试此操作时，我发现在呈现rmarkdown时，出于某种原因，我需要使用

default\u file

而不是

file

指定文件名。@nongkrong太好了，HTH。我没有用Rscript测试它，但它也应该能与该接口一起工作；无论如何，我认为

launch.browser

参数是这里的关键。

#!/usr/bin/env r

rmarkdown::run(
  file = "testRMD.rmd",
  dir = "~/tmp/delete",
  shiny_args = list(
    port = 7088,
    launch.browser = TRUE,
    host = "127.0.0.1"))

[nathan@nrussell R]$ chmod +x testapp.r testRMD.r

[nathan@nrussell R]$ ./testapp.r
Loading required package: shiny

Listening on http://127.0.0.1:7088

[nathan@nrussell R]$ ./testRMD.r
Loading required package: shiny

Listening on http://127.0.0.1:7088

REM Change to correct directory
cd "C:\Users\me\Documents\project_folder\"

REM Print files available (not required, but helpful)
dir

REM Point system to R's Pandoc with Rscript then launch
"C:\Program Files\R\R-4.0.3\bin\Rscript.exe" -e ^
"Sys.setenv(RSTUDIO_PANDOC='C:/Users/me/Documents/RStudio/bin/pandoc'); rmarkdown::run(file = 'myInteractiveMarkdown.Rmd', shiny_args = list(launch.browser = TRUE, host = '127.0.0.1'))"