在R中的所有并行作业完成后提交新脚本

我有一个R脚本，它可以创建多个脚本并将这些脚本同时提交到计算机集群，在所有多个脚本都完成并将输出写入相应的文件夹后，我想自动启动另一个R脚本，该脚本可以处理这些输出

我还没有弄清楚在R中是否有这样做的方法：函数“wait”不是我想要的，因为脚本作为不同的作业提交，每个作业在不同的时间完成并写入其输出文件，但我实际上希望在所有输出出现后运行后续脚本

我想到的一种方法是计算已创建的文件，如果有正确数量的输出文件，则提交下一个脚本。然而，要做到这一点，我想我必须打开一个脚本，不时检查文件的存在，我不确定这是否是一个好主意，因为可能需要一天或更长的时间才能完成第一个脚本

你能帮我找到解决办法吗

非常感谢你的帮助

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-fra

我认为你的看法是错误的：

• 根本不是R问题，R恰好是批处理作业的客户机

• 这是队列/批处理程序可以在集群上解决的问题

• 最糟糕的情况是，您可以在shell（或R脚本）中等待/休眠，直到触及“最终条件已达到”文件

• 相互依赖关系也可以用make表示

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您使用的是什么操作系统？在Unix中，我知道还有其他调度任务可能更适合这种情况…？嗨，Chase，是的，操作系统是Linux，什么样的调度任务？我会让Dirk接管…他在这些事情上比我做得好得多，并且提到了我想到的大多数事情（和其他人）…祝你好运！嗨，德克，谢谢你。在集群中似乎没有这样做的功能，也许正如您所说，执行等待/睡眠脚本会很好，但是如何设置“最终达到条件”文件？是通过检查是否所有输出文件都存在吗？脚本的第一行：

[test-f done.txt&&rm done.txt

。最后一行：

触摸done.txt

。然后另一个脚本在[！-f done.txt]时执行

；睡觉5；完成

或其他什么。但这是一个超级黑客行为。一定要和当地专家谈谈：如果有集群，通常有更好的解决方案：slurm、torque、pbs、condor……哦，欢迎来到StackOverflow。它将进行“向上投票”（点击指向上方的三角形）和/或“接受”（点击TigkMax；只有当你问问题的人看到你）回答你认为是有用的。