R 成对差异交叉表

假设我有一个数据框，其中有两个变量，对应于为不同组a、B和C计算的两个指数。因此，数据帧本质上是：

 >df
   Group      v.1      v.2
     A         2        3
     B         4        4
     C         7        9

我想计算每个变量的成对差异（

v.1

和

v.2

），然后以交叉表格格式绘制结果，因此对角线下方的值给出了

v.1

和上对角线中的成对差异，

v.2

中的成对差异值。因此，结果如下所示：

        A       B       C 
   A    0       1       6
   B    2       0       5
   C    5       3       0

---

是否有任何方案可以帮助我实现这一目标？欢迎提出任何建议

您可能可以使用

combn

+

diff

以及

upper.tri

和

lower.tri

，如下所示：

m <- matrix(0, nrow = nrow(df), ncol = nrow(df), 
            dimnames=list(df$Group, df$Group))
m
#   A B C
# A 0 0 0
# B 0 0 0
# C 0 0 0

m[lower.tri(m)] <- combn(df$v.1, 2, FUN=diff)
m[upper.tri(m)] <- combn(df$v.2, 2, FUN=diff)
m
#   A B C
# A 0 1 6
# B 2 0 5
# C 5 3 0

---

m您可能可以使用
combn
+
diff
以及
upper.tri
和
lower.tri
，如下所示：

m <- matrix(0, nrow = nrow(df), ncol = nrow(df), 
            dimnames=list(df$Group, df$Group))
m
#   A B C
# A 0 0 0
# B 0 0 0
# C 0 0 0

m[lower.tri(m)] <- combn(df$v.1, 2, FUN=diff)
m[upper.tri(m)] <- combn(df$v.2, 2, FUN=diff)
m
#   A B C
# A 0 1 6
# B 2 0 5
# C 5 3 0

m不像@A5C1D2H2I1M1N2O1R2T1的解决方案那样平滑，但也可以使用R
base
包中的
outer
函数来实现这一点：

df <- read.table(text =
                   "Group      v.1      v.2
                      A         2        3
                      B         4        4
                      C         7        9",
                 header = TRUE)

# matrix of pairwise differences for v.1
mat_dif1 <- outer(X = df$v.1, Y = df$v.1, FUN = "-")
mat_dif1[mat_dif1<0] <- 0

# matrix of pairwise differences for v.2
mat_dif2 <- outer(X = df$v.2, Y = df$v.2, FUN = "-")
mat_dif2[mat_dif2>0] <- 0

mat_dif1 + abs(mat_dif2)

##      [,1] [,2] [,3]
## [1,]    0    1    6
## [2,]    2    0    5
## [3,]    5    3    0

df不像@A5C1D2H2I1M1N2O1R2T1的解决方案那样平滑，但也可以使用R
base
包中的
outer
函数来实现这一点：

df <- read.table(text =
                   "Group      v.1      v.2
                      A         2        3
                      B         4        4
                      C         7        9",
                 header = TRUE)

# matrix of pairwise differences for v.1
mat_dif1 <- outer(X = df$v.1, Y = df$v.1, FUN = "-")
mat_dif1[mat_dif1<0] <- 0

# matrix of pairwise differences for v.2
mat_dif2 <- outer(X = df$v.2, Y = df$v.2, FUN = "-")
mat_dif2[mat_dif2>0] <- 0

mat_dif1 + abs(mat_dif2)

##      [,1] [,2] [,3]
## [1,]    0    1    6
## [2,]    2    0    5
## [3,]    5    3    0

df