R 精确匹配某些列,某些列部分匹配内部连接

R 精确匹配某些列,某些列部分匹配内部连接,r,fuzzyjoin,R,Fuzzyjoin,我有两个来自不同来源的数据框,它们指向同一个人,但由于自报数据的错误,日期可能会稍微偏离 示例数据: df1 <- data.frame(name= c("Ann", "Betsy", "Charlie", "Dave"), dob= c(as.Date("2000-01-01", "%Y-%m-%d"), as.Date("

我有两个来自不同来源的数据框,它们指向同一个人,但由于自报数据的错误,日期可能会稍微偏离

示例数据:

df1 <- data.frame(name= c("Ann", "Betsy", "Charlie", "Dave"), 
                  dob= c(as.Date("2000-01-01", "%Y-%m-%d"), as.Date("2001-01-01", "%Y-%m-%d"), 
                         as.Date("2002-01-01", "%Y-%m-%d"), as.Date("2003-01-01", "%Y-%m-%d")), 
                  stringsAsFactors=FALSE)

df2 <- data.frame(name= c("Ann", "Charlie", "Elmer", "Fred"), 
                  dob= c(as.Date("2000-01-11", "%Y-%m-%d"), as.Date("2004-01-01", "%Y-%m-%d"), 
                         as.Date("2001-01-01", "%Y-%m-%d"), as.Date("2006-01-01", "%Y-%m-%d")), 
                  stringsAsFactors=FALSE)
但也要在30天内以出生日期(dob)为准,fuzzyjoin软件包如下:

library(fuzzyjoin)

difference_inner_join(df1, df2, by=c("dob"), max_dist = 30)

name.x  dob.x   name.y  dob.y
Ann     2000-01-01  Ann     2000-01-11
Betsy   2001-01-01  Elmer   2001-01-01

但是将这两个条件结合起来,这样只有Ann会被返回

您可以这样做:

 difference_inner_join(df1, df2, by=c("dob"), max_dist = 30) %>%
  filter(name.x == name.y)

  name.x      dob.x name.y      dob.y
1    Ann 2000-01-01    Ann 2000-01-11


仅依靠dplyr和base R。 我很少需要模糊连接<代码>内部连接和随后的
过滤器
通常就足够了

inner_join(df1, df2, by = c("name")) %>% 
  filter(abs(difftime(dob.x,dob.y, units = "days"))<30)

完美的我早些时候用循环实现了这一点,在实际数据上花费了>5分钟,行数>100000。您的解决方案在中有效我希望找到一个函数调用,将其全部放入
fuzzy\u-inner\u-join
s
match\u-fun=list(…)
,但它似乎需要
=
=
我认为您的解决方案比将其全部放入inner\u-join函数更具可读性
inner_join(df1, df2, by = c("name")) %>% 
  filter(abs(difftime(dob.x,dob.y, units = "days"))<30)
  name      dob.x      dob.y
 1  Ann 2000-01-01 2000-01-11