R Isomap中的数据是碎片化的

我有一个问题，关于

R

上的isomap，我使用带有距离平方矩阵的

vegan

包：

isomap（Dist，k=2）

我仍然有这个错误：

isomapdist（Dist）中的错误；数据不完整

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我不明白那是什么意思

Isomap将使用仅使用k近邻的点间路径计算点间距离-在您的情况下，使用三个近邻。如果数据由断开连接的组件组成，则仅使用第k个最近邻的点之间可能没有任何路径。根据您试图完成的任务，将数据拆分为连接的集群并在每个集群上运行isomap可能就足够了

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我希望这会有所帮助

使用参数

epsilon

而不是

k

，并将其调整到一个合适的值以获得成功

library(vegan)
iso <- isomap(d, ndim=1, epsilon=0.3)

library（素食主义者）
iso在寻求帮助时，请提供帮助。对于特定的错误消息，并不总是有一个原因。这是谷歌硬盘上距离的平方矩阵：这是行代码ord