R 使用一个数据集中的两个Y自动化多个绘图/图形
我试图用两个Y变量绘制34个单独的时间曲线图。我的数据集是结构化的:X Y1A Y2A Y1B Y2B。Y1n Y2n 我可以通过简单地让ggplot绘制我想要的列来获得单独的plot。然而,在5个数据集中,我有34个绘图要做,所以自动化这将是有用的。我真的被困在如何构造语言来实现我想要它做的事情上。(新用户)。我不擅长for循环,甚至不知道这是否正是我想要使用的代码结构。我已经研究了R 使用一个数据集中的两个Y自动化多个绘图/图形,r,for-loop,ggplot2,R,For Loop,Ggplot2,我试图用两个Y变量绘制34个单独的时间曲线图。我的数据集是结构化的:X Y1A Y2A Y1B Y2B。Y1n Y2n 我可以通过简单地让ggplot绘制我想要的列来获得单独的plot。然而,在5个数据集中,我有34个绘图要做,所以自动化这将是有用的。我真的被困在如何构造语言来实现我想要它做的事情上。(新用户)。我不擅长for循环,甚至不知道这是否正是我想要使用的代码结构。我已经研究了apply函数,这些函数似乎并没有达到我想要的效果,因为我并没有试图操作我的数据,而是一次将所有数据绘制成图形
apply
函数,这些函数似乎并没有达到我想要的效果,因为我并没有试图操作我的数据,而是一次将所有数据绘制成图形
我没有尝试过melt
,但我再次陷入了如何一次创建两行的困境。我应该给我的专栏命名一些不同的/更容易自动化的名称吗
我搜索了几个小时,没有找到任何能完全回答我问题的东西
df <- matrix( c( 1, 0.011, 0.002, 0.007, 0.002,
2, 0.011, NA, 0.007, NA,
3, 0.010, 0.002, 0.007, 0.002,
4, 0.010, NA, 0.007, NA,
5, 0.010, NA, 0.006, NA,
6, 0.010, 0.002, 0.006, 0.002
), nrow = 6, ncol= 5, byrow= TRUE)
colnames(df)<- c("time", "prefish1", "obsfish1", "prefish2", "obsfish2")
biomass<-as.data.frame(df)
编辑
我刚试过这个:
pre<- biomass[+c(2,4)]
obs<- biomass[+c(3,5)]
for(i in 1:NCOL(pre)){
}
for(k in 1:NCOL(obs)){
plot(biomass$time, pre[,i], type= "l", xlab= "time", ylab ="biomass t/km2")
par(new= TRUE)
plot(biomass$time, obs[,k], type = "p", main = paste("Fit", names(obs)[k]), xlab= "time", ylab ="biomass t/km2")
}
pre分面方法可以工作吗,还是需要单独的输出文件
在ggplot中实现这一点最常见的方法是将单独的运行放入facet中。要做到这一点,我们需要在将数据输入ggplot之前对其进行重塑:我们可以有一对列,另一列(num
下面)指定每一行与哪个图形相关,而不是在每个图形的数据中有单独的列对。然后我们可以使用num
变量映射到facet。(我们也可以使用相同的准备来完成第二项任务…)
另一个选项:构建用于打印的函数。然后创建两个名称向量,同时循环它们,传递给新创建的函数,并将结果保存在列表中。然后使用plot\u grid
将所有绘图组合在一起
库(tidyverse)
##绘图函数
my_bio_plot请使用dput(您的_数据)
添加一个可复制的数据示例。谢谢!我一直在考虑如何使用这个。目前,我想单独的输出文件。但我会玩一下这个。这里有一个类似的问题:我通过调用一个新的绘图窗口来实现它!非常感谢。或者您可以使用ggsave
。如果一页中的绘图太多,
pre<- biomass[+c(2,4)]
obs<- biomass[+c(3,5)]
for(i in 1:NCOL(pre)){
}
for(k in 1:NCOL(obs)){
plot(biomass$time, pre[,i], type= "l", xlab= "time", ylab ="biomass t/km2")
par(new= TRUE)
plot(biomass$time, obs[,k], type = "p", main = paste("Fit", names(obs)[k]), xlab= "time", ylab ="biomass t/km2")
}
library(tidyr) # Useful for reshaping the data
library(ggplot2)
biomass %>%
# Gather data into long format
gather(column, value, -time) %>%
# Separate the number of graph from the type of column
separate(column, c("var", "num"), sep = -1) %>%
# Put the two types of column back into separate columns
spread(var, value) %>%
ggplot(aes(x= time, group = num)) +
geom_line(aes(y = prefish)) +
geom_point(aes(y= obsfish)) +
facet_wrap(~num) +
ylab("biomass t/km2") +
##I would also like to title them using the header one of the column pairs##
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