从下载的文件向R读取软文件数据

我已经从GSE47875断言号下载了软文件数据到我的labtop。现在我想把它加载到R，我已经用过了

getGEO("GSE47875",filename = "Desktop/GSE47875/GSE47875_series_matrix.txt.gz")

但我遇到了以下错误：

sh: 1: curl: not found
File stored at: 
/tmp/RtmpHyQAgg/GPL1355.soft
Error in file(fname, "r") : cannot open the connection
In addition: Warning messages:
1: In download.file(myurl, destfile, mode = mode, quiet = TRUE, method = getOption("download.file.method.GEOquery")) :
  download had nonzero exit status
2: In file(fname, "r") :
  cannot open file '/tmp/RtmpHyQAgg/GPL1355.soft': No such file or directory

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问题在哪里？如何将软文件数据加载到R？

看起来您是在Linux上，并且没有安装

curl

（从命令行或脚本下载的程序）。它是免费的，所以请安装它！您可以使用

sudo-apt-get-install-curl

在Debian类型的发行版上安装它

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有更多的细节。

似乎与卷曲有关的问题。