在OpenCPU/包上找到自定义R包，但没有可见的函数

CI已经为OpenCPU编写了一个R包，并希望在我自己的云服务器上使用它。我无法访问任何函数，即使包本身已被识别并可以更新，我也可以通过POST和GET正常访问其他（非自定义，例如base或stats）包

我已经安装了自定义软件包以及

/usr/local/lib/R/site library

的所有依赖项，并且我可以在服务器本地的R会话中使用这些功能

> TestConnectivity
function (x = 100) 
{
    return(sum(rnorm(x)))
}
<environment: namespace:MyPkg>
> TestConnectivity()
[1] 4.174071

但当我在

/ocpu/library/MyPkg/R/TestConnectivity

通过OpenCPU（通过浏览器或curl）访问它时，我得到：

object 'TestConnectivity' not found

In call:
get(reqobject, paste("package", reqpackage, sep = ":"), inherits = FALSE)

/ocpu/library/MyPkg/R/

也为空（通常，需要导出函数的列表），但通过

/ocpu/library/MyPkg/

的浏览器可以看到包本身：

    Information on package 'MyPkg'

Description:

Package:       MyPkg
Description:   in development ...
Type:          Package
Version:       0.1.2
[...]

Index:

TestConnectivity        Test Connectivity of OpenCPU
MyPkg                   Provide R analysis of stored data.
MyPkg-package           Calculation package

我已将其名称添加到

/etc/opencpu/server.conf

中的preload字段中，但

/ocpu/info

仅将其显示为通过命名空间加载的

（未附加）：[n]MyPkg_0.1.2

。我不知道，这是不是个问题

我还添加了对包功能所需的所有文件的访问权限，例如ODBC数据库连接的DSN配置文件

包本身不仅包含函数，还包含组合的

R6

和

S3

类定义（单个文件中的继承）――但是，在

TestConnectivity（）

中没有使用这些定义。函数也不总是放在与函数名称完全相同的文件中，有时几个函数组合在一个文件中。（

TestConnectivity（）

放在相应的

TestConnectivity.R

文件中-如果有必要的话。）

与在本地使用包相比，使用OpenCPU时是否存在一些文件结构方面的限制，这可能会导致此问题？或者类定义文件可能是问题的原因？非常感谢您的建议。

谢谢您的回答（顺便说一句，OpenCPU上的伟大工作…）

我只需将包安装在

/home/myUser/R/3.1/library

，例如

.libpath（）[1]

（或

R-LIBS-USER[1]

）而不是

/usr/local/lib/R/site library

，就解决了我的问题

我通过逐步建立一个越来越复杂的测试包达到了目的。。。在我几乎拥有实际项目结构的时候，它仍然有效。唯一不同的是安装路径

总而言之，这可能是我的虚拟机上的权限管理问题，而不是OpenCPU或我的软件包的问题。很抱歉，我不能提供更多的信息-如果我偶然发现了什么，我将在这里添加它

---

编辑-我忘了：当然，url从

/ocpu/library/MyPkg/R/

变为

/ocpu/user/MyUsername/library/MyPkg/R/

，

你似乎做得不错。OpenCPU中的R包没有额外的限制。你的代码在什么地方公开吗？还是显示问题的简单版本的软件包？如果您提供一个我们可以测试的示例，将更容易帮助您。

    Information on package 'MyPkg'

Description:

Package:       MyPkg
Description:   in development ...
Type:          Package
Version:       0.1.2
[...]

Index:

TestConnectivity        Test Connectivity of OpenCPU
MyPkg                   Provide R analysis of stored data.
MyPkg-package           Calculation package