Warning: file_get_contents(/data/phpspider/zhask/data//catemap/4/regex/18.json): failed to open stream: No such file or directory in /data/phpspider/zhask/libs/function.php on line 167

Warning: Invalid argument supplied for foreach() in /data/phpspider/zhask/libs/tag.function.php on line 1116

Notice: Undefined index: in /data/phpspider/zhask/libs/function.php on line 180

Warning: array_chunk() expects parameter 1 to be array, null given in /data/phpspider/zhask/libs/function.php on line 181
Sed 如何解释:标签;N在下面提到的行中_Sed - Fatal编程技术网

Sed 如何解释:标签;N在下面提到的行中

Sed 如何解释:标签;N在下面提到的行中,sed,Sed,的解释是什么:标签;在下面提到的命令中,N和b标签 sed -i ':label;N;s/\+.*\n.*\n//;b label' paired.fa piared.fa看起来像这样 @HWI-ST963:188:C29Y5ACXX:4:1107:1493:57038/1:@HWI-ST963:188:C29Y5ACXX:4:2307:16619:181383/2 GAGCCCCGCTTCATCGCCGTGGGCTACGTGGACGACACGCAGTTCGTGCGGTTCGACAGCGACG

的解释是什么:标签;在下面提到的命令中,N
b标签

sed -i ':label;N;s/\+.*\n.*\n//;b label' paired.fa
piared.fa
看起来像这样

@HWI-ST963:188:C29Y5ACXX:4:1107:1493:57038/1:@HWI-ST963:188:C29Y5ACXX:4:2307:16619:181383/2
GAGCCCCGCTTCATCGCCGTGGGCTACGTGGACGACACGCAGTTCGTGCGGTTCGACAGCGACGCCGCGAGCCAGAAGATGGAGCCGCGGGCGCCGTGGAT:TCCATGAGGTATTTCTTCACATCCGTGTCCCGGCCCGGCCGCGGGGAGCCCCGCTTCATCGCCGTGGGCTACGTGGACGACACGCAGTTCGTGCGGTTCGA
+:+
@CCFFFFFHHHGHIIFIIJGHGGGHIIJFGGGG0AH>GEHFFFEED=?@BD?B?BABDDDDDDBBDBBDBDDDCBBDCDCCCCDDDDDDBBBBDBB5<B@C:@@CFFFFFHFHHHJJJJJIJJIIJJJJJIJJJJJJJGGIJEHEFDDBDDD@BBDBDDDEEDDDDBDDDDCDDDDDDDDDBD>BBDDDDDDDBDDDD5<BD@
@HWI-ST963:188:C29Y5ACXX:4:2307:16619:181383/1:@HWI-ST963:188:C29Y5ACXX:4:2307:7539:10902/2
CCCTCCTGCTCTATCCACGGCGCCCGCGGCTCCATCTTCTGGCTCGCGGCGTCGCTGTCGAACCGCACGAACTGCGTGTCGTCCACGTAGCCCACGGCGAT:GAGCCCCGCTTCATCGCCGTGGGCTACGTGGACGACACGCAGTTCGTGCGGTTCGACAGCGACGCCGCGAGCCAGAAGATGGAGCCGCGGGCGCCGTGGAT
+:+
CCCFFFFFHHHHHJJIJIJJJJJJJJJJIJJJHGHHHHFFFFFCE?BBB<<07<@BB@C@A@ADBD;BDBDDACD95<9BDBBD@DDBCBBDDBDBBB@@9:CCCFFFFFHHHGHJJJJJJIJJJJJJJJJJJIJJJJIJHHFFFEEDCDDDB?BDDDDDDDDDDDBDDDDDDDDDDDDDCDDDDDDDDDDDDDDDDD<BD?@
@HWI-ST963:188:C29Y5ACXX:4:2307:7539:10902/1:@HWI-ST963:188:C29Y5ACXX:4:1107:1493:57038/2
GCCTTCATATTCCGTGTCTCCTGGTCCCAATACTCCGGCCCCTCCTGCTCTATCCACGGCGCCCGCGGCTCCATCTTCTGGCTCGCGGCGTCGCTGTCGAA:GCCTTCATATTCCGTGTCTCCTGGTCCCAATACTCCGGCCCCTCCTGCTCTATCCACGGCGCCCGCGGCTCCATCTTCTGGCTCGCGGCGTCGCTGTCGAA
+:+
CCCFFFFFHHHHHIHHHIJJJIJJIJJJJIJJJJJJJIJJJJJJIIJIJJJIGIHIJJJGFDDBDDDDDDDDDDDDDEDDDDDD9@>B@@9@BB9><A8<@:@CCFFFFFHHGHHIGHGHIIGIJJDHHIJIHHIIIHIGGGHJGIJCEHEHHHJEHJIIJHFDDDDDD@DDDDDCDDCDDCDDDD799>B95<9<>.5:(8@
@HWI-ST963:188:C29Y5ACXX:4:1107:1493:57038/1:@HWI-ST963:188:C29Y5ACXX:4:2307:16619:181383/2
GAGCCCGCTTCATCGCCGTGGGCTACGTGGCGCGCGCGCGCGCGCGCGCGCGCGCGCGCGCGCGCGCAGCAGAGAGAGGAGCGCGCGGGCGCGCGGCGCGCGCGCGCGCGCGCGCGCGCGCGCGCGCGCGCGCGCGCGCGCGCGCGCGCGCGCGCGCGCGCGCGCGCGCGCGCGCGCGCGCGCGCGCGCGCGCGCGCGCGCGCGCGCGCGCGCGCGCGCGCGCGCGCGCGCGCGCGCGCGCGCGCGCGCGCGCGCGCGCGCGCGCGCGCGCGCGCGCGCGCGCGCGCGCGC
+:+
@CCFFFFFHHHGHIIFIIJGHGGGHIIJFGGGG0AH>GEHFFFED=?@BD?B?Babdddddddddbbdbbdddcbbdcdcccddddddbbbbbbb5bdddddddddddddd5
  • :label
    是一个标签,表示代码中的位置标记

  • N
    表示读入下一行并将其添加到当前图案空间的末尾,前面加一个换行符

    在执行
    N
    之前,sed的模式空间保存它所保存的任何内容。执行
    N
    后,它保存(a)之前的内容,(b)换行符,以及(c)从文件中读取的下一行

  • b label
    表示分支到名为
    label
    的位置


  • 此代码的最终效果是查找包含加号的行,
    +
    ,并删除从该加号到带加号的行后下一行末尾的所有内容。

    我仍然不太清楚。什么是需要使用的标签。不能使用sed-i's/\+.*\n.*\n//g'paired.fa执行上述操作thing@DHWANIDHOLAKIA通常,sed一次只读取一行。
    N
    和循环需要读入多行,以便它可以进行您想要的替换。请您以更简单的方式解释上面命令中的N,我怀疑这是错误代码。我认为这是为了删除包含
    +
    的行和下面的行。但是,这并不考虑文件结束边缘的情况。另一种解决方案是
    sed-i'/+/{N;d}文件
    或者如果边缘大小写不是错误
    sed-i'/+/{N;$!d}文件