Shell 从bed文件中删除行
我制作了一个像这样的床锉Shell 从bed文件中删除行,shell,file,bioinformatics,Shell,File,Bioinformatics,我制作了一个像这样的床锉 Simple_repeat KQ420259.1 45090 45150 (TTAT)n . + Simple_repeat KQ420259.1 46815 46864 (TG)n . + Simple_repeat KQ420259.1 47062 47104 (GT)n . + SINE/tRNA-Deu KQ420259.1 49227 49290 AmnSINE2 . + S
Simple_repeat KQ420259.1 45090 45150 (TTAT)n . +
Simple_repeat KQ420259.1 46815 46864 (TG)n . +
Simple_repeat KQ420259.1 47062 47104 (GT)n . +
SINE/tRNA-Deu KQ420259.1 49227 49290 AmnSINE2 . +
Simple_repeat KQ416943.1 112522 112609 (ATAC)n . +
Simple_repeat KQ416943.1 113250 113283 (ACA)n . +
Simple_repeat KQ416943.1 113283 113358 (ACT)n . +
Simple_repeat KQ416943.1 117308 117357 (AC)n . +
Simple_repeat KQ416943.1 117357 117435 (ACAC)n . +
Simple_repeat KQ416944.1 117964 118025 (TATG)n . +
DNA/TcMar KQ416944.1 121083 121651 HSMAR1 . +
Low_complexity KQ416944.1 124929 124970 A-rich . +
我想消除所有包含KQ416943.1
的行。我不知道是否存在一种维护秩序的方法。我会感谢你的帮助。谢谢试试这个:
grep -v "KQ416943.1" yourfile.txt > output.txt
试试这个:
grep -v "KQ416943.1" yourfile.txt > output.txt
1) 这不是床锉。2) 搜索
grep
为什么不?有名字、职位、职位。我认为这是一张床文件的前三列:CHROM/START/END:可能与1)这不是一张床文件。2) 搜索grep
为什么不?有名字、职位、职位。我认为BED文件的前三列是:CHROM/START/END: